MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4206953797 · doi:10.1371/journal.pone.0262806

The adult microbiome of healthy and otitis patients: Definition of the core healthy and diseased ear microbiomes

2022· article· en· W4206953797 sur OpenAlexaff
Maria Burton, Janina A. Krumbeck, Guangxi Wu, Shuiquan Tang, Aishani Prem, Aditya Gupta, Thomas L. Dawson

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEar Surgery and Otitis Media
Établissements canadiensMediprobe Research (Canada)University of Toronto
Organismes subventionnairesAgency for Science, Technology and Research
Mots-clésMicrobiomeMalasseziaOtitisBiologyMicrobiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Otitis media (OM) and externa (OE) are painful, recurrent ear conditions. As most otitis publications focus on the bacterial content of childhood ears, there remains a dearth of information regarding the adult ear microbiome including both bacteria and fungi. This study compares the outer ear microbiome of healthy adults to adults affected by OE and OM using both intergenic-transcribed-spacer (ITS) and 16S-rDNA sequencing. The adult ear core microbiome consists of the prokaryote Cutibacterium acnes and the eukaryotic Malassezia arunalokei, M. globosa, and M. restricta. The healthy ear mycobiome is dominated by Malassezia and can be divided into two groups, one dominated by M. arunalokei, the other by M. restricta. Microbiome diversity and biomass varied significantly between healthy and diseased ears, and analyses reveal the presence of a potential mutualistic, protective effect of Malassezia species and C. acnes. The healthy ear core microbiome includes the bacteria Staphylococcus capitis and S. capitis/caprae, while the diseased ear core is composed of known bacterial and fungal pathogens including Aspergillus sp., Candida sp., Pseudomonas aeruginosa, S. aureus, and Corynebacterium jeikeium. The data presented highlight the need for early detection of the cause of otitis to direct more appropriate, efficient treatments. This will improve patient outcomes and promote improved antimicrobial stewardship.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetEar Surgery and Otitis MediaTravaux en français237 207