Semi-Quantitative Detection of<i>Drosophila suzukii</i>(Diptera: Drosophilidae) From Bulk Trap Samples Using PCR Technology
Notice bibliographique
Résumé
Drosophila suzukii (Matsumura) (Diptera: Drosophilidae) is a ubiquitous global pest of several fruit crops. Trapped adult numbers are used to monitor populations and make control decisions, but differentiating D. suzukii from other trapped Drosophila spp. is laborious. We developed a real-time PCR method for specific detection and semi-quantification of D. suzukii from trap samples. The PCR assay did not amplify DNA from 29 other Drosophilidae species tested. Drosophila suzukii was detected from ≥0.96 pg target DNA and from laboratory samples containing one D. suzukii in 2000 other Drosophila spp. flies. We tested DNA stability of one D. suzukii in 100 Drosophila spp. flies in water or ethanol at 20, 25, or 30°C for 1, 4, or 7 d. Only water at 30°C for 7 d fully impaired D. suzukii DNA detectability. Substituting mouthwash for water resulted in D. suzukii detection in all samples held for 7 d at 30°C or daily fluctuating temperatures of 33/23°C. Traps with mouthwash as a drowning liquid had D. suzukii captures equal to traps with water. A calibration curve was established using samples in mouthwash containing 1/1,000-100/1,000 D. suzukii/total Drosophila spp. flies and incubated at 25°C for 7 d. The curve had a coefficient of determination (R2) of 0.9279 between D. suzukii numbers from the PCR and the true D. suzukii numbers in samples prepared in 70% ethanol. Collecting samples in mouthwash is expected to improve detection accuracy, and the qPCR method can be a useful tool to support D. suzukii monitoring and management.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».