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Enregistrement W4207085673 · doi:10.1101/2022.01.24.22269144

Super-Resolution of Magnetic Resonance Images Acquired Under Clinical Protocols using Deep Attention-based Method

2022· preprint· en· W4207085673 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAdvanced Image Processing Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUK Dementia Research InstituteChina Scholarship CouncilFondation LeducqUniversity of EdinburghStroke AssociationAlzheimer's SocietyWellcome TrustMrs Gladys Row Fogo Charitable TrustWeston Brain InstituteUK Research and InnovationEdinburgh and Lothians Health Foundation
Mots-clésInterpretabilityFluid-attenuated inversion recoveryArtificial intelligenceMagnetic resonance imagingNeuroimagingComputer scienceFeature (linguistics)Image qualityPattern recognition (psychology)Ground truthNuclear medicineComputer visionMedicineRadiologyImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A bstract Vast quantities of Magnetic Resonance Images (MRI) are routinely acquired in clinical practice but, to speed up acquisition, these scans are typically of a quality that is sufficient for clinical diagnosis but sub-optimal for large-scale precision medicine, computational diagnostics, and large-scale neuroimaging research. Here, we present a critic-guided framework to upsample low-resolution (often 2D) MRI scans. In addition, we incorporated feature-importance and self-attention methods into our model to improve the interpretability of this work. We evaluate our framework on paired low- and high-resolution brain MRI structural full scans (i.e. T1-, T2-weighted and FLAIR sequences are simultaneously input) obtained in clinical and research settings from scanners manufactured by Siemens, Phillips and GE. We showed that the upsampled MRIs are qualitatively faithful to the ground-truth high-quality scans ( PSNR = 35.39; MAE = 3.78 E −3; NMSE = 4.32 E −10; SSIM = 0.9852; mean normal-appearing grey/white matter ratio intensity differences ranging from 0.0363 to 0.0784 for FLAIR, from 0.0010 to 0.0138 for T1-weighted and from 0.0156 to 0.074 for T2-weighted sequences). The automatic raw segmentations of tissues and lesions using the super-resolved images have fewer false positives and higher accuracy than those obtained from interpolated images in protocols represented with more than three sets in the training sample, making our approach a strong candidate for practical application in clinical research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,877
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle