Comparison of individual hive and apiary-level sample types for spores of Paenibacillus larvae in Saskatchewan honey bee operations
Notice bibliographique
Résumé
Three commercial honey bee operations in Saskatchewan, Canada, with outbreaks of American foulbrood (AFB) and recent or ongoing metaphylactic antibiotic use were intensively sampled to detect spores of Paenibacillus larvae during the summer of 2019. Here, we compared spore concentrations in different sample types within individual hives, assessed the surrogacy potential of honey collected from honey supers in place of brood chamber honey or adult bees within hives, and evaluated the ability of pooled, extracted honey to predict the degree of spore contamination identified through individual hive testing. Samples of honey and bees from hives within apiaries with a recent, confirmed case of AFB in a single hive (index apiaries) and apiaries without clinical evidence of AFB (unaffected apiaries), as well as pooled, apiary-level honey samples from end-of-season extraction, were collected and cultured to detect and enumerate spores. Only a few hives were heavily contaminated by spores in any given apiary. All operations were different from one another with regard to both the overall degree of spore contamination across apiaries and the distribution of spores between index apiaries and unaffected apiaries. Within operations, individual hive spore concentrations in unaffected apiaries were significantly different from index apiaries in the brood chamber (BC) honey, honey super (HS) honey, and BC bees of one of three operations. Across all operations, BC honey was best for discriminating index apiaries from unaffected apiaries (p = 0.001), followed by HS honey (p = 0.06), and BC bees (p = 0.398). HS honey positively correlated with both BC honey (rs = 0.76, p < 0.0001) and bees (rs = 0.50, p < 0.0001) and may be useful as a surrogate for either. Spore concentrations in pooled, extracted honey seem to have predictive potential for overall spore contamination within each operation and may have prognostic value in assessing the risk of future AFB outbreaks at the apiary (or operation) level.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».