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Enregistrement W4210270249 · doi:10.4049/jimmunol.2100962

A Novel Non–Mammalian-Specific HERC7 Negatively Regulates IFN Response through Degrading RLR Signaling Factors

2022· article· en· W4210270249 sur OpenAlexaff
Yilin Li, Xiu-Ying Gong, Zi-Ling Qu, Xiang Zhao, Jian‐Fang Gui, Yi-Bing Zhang

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaChinese Academy of Sciences
Mots-clésBiologyUbiquitin ligaseSubfamilyCell biologyMediatorActivator (genetics)Transcription factorInterferon regulatory factorsGeneRegulatorUbiquitinCrucian carpIRF1GeneticsFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The small HERC family currently comprises four members (HERC3-6) involved in the regulation of various physiological activities. Little is known about the role of HERCs in IFN response. In this study, we identify a novel fish HERC member, named crucian carp HERC7, as a negative regulator of fish IFN response. Genome-wide search of homologs and comprehensive phylogenetic analyses reveal that the small HERC family, apart from HERC3-6 that have been well-characterized in mammals, contains a novel HERC7 subfamily exclusively in nonmammalian vertebrates. Lineage-specific and even species-specific expansion of HERC7 subfamily in fish indicates that crucian carp HERC7 might be species-specific. In virally infected fish cells, HERC7 is induced by IFN and selectively targets three retinoic acid-inducible gene-I-like receptor signaling factors for degradation to attenuate IFN response by two distinct strategies. Mechanistically, HERC7 delivers mediator of IFN regulatory factor 3 activator and mitochondrial antiviral signaling protein for proteasome-dependent degradation at the protein level and facilitates IFN regulatory factor 7 transcript decay at the mRNA level, thus abrogating cellular IFN induction to promote virus replication. Whereas HERC7 is a putative E3 ligase, the E3 ligase activity is not required for its negative regulatory function. These results demonstrate that the ongoing expansion of the small HERC family generates a novel HERC7 to fine-tune fish IFN antiviral response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,111
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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