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Enregistrement W4210319484 · doi:10.1002/alz.054719

The relationship between brain‐age association and prediction: The impact of parameter selection

2021· article· en· W4210319484 sur OpenAlexaffabout
Yashar Zeighami, Alan C. Evans

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSmoothingCorrelationBrain atlasNeuroimagingPsychologyPattern recognition (psychology)Artificial intelligenceMathematicsStatisticsNeuroscienceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Association and prediction studies of brain age target the relationships between neuroanatomical changes across lifespan and behavioural or pathological phenotypes. However, the relationship between the two analyses has not been directly examined. Here we use brain resels (i.e. resolution elements) (Worsley et al. 1996) to directly compare age association and brain‐age prediction as a function of cortical thickness smoothing and parcellation parameters. Method Data included 608 healthy subjects (Age = 53.5218.07; Age range = 18‐88, 308 Female subjects) subjects with T1‐weighted MRI from the Cambridge Centre for Ageing and Neuroscience (https://www.cam‐can.org/index.php?content=dataset). CIVET pipeline (http://www.bic.mni.mcgill.ca/ServicesSoftware/CIVET) was used to extract cortical surfaces and calculate cortical thickness across the brain. We used 6 different diffusion based smoothing kernels (0, 5, 10, 20, 30, and 40 mm) and 5 different parcellation levels: 100, 200, 400, and 1000 parcels from Schaefer et al., 2018 multi‐level functional parcellation atlas as well as the entire cortex. For each level of smoothing and parcellation, age‐related correlations were calculated. Brain age was predicted using a linear regression model with 10‐fold cross validation, with principal components of cortical thickness data as predictors. To directly compare the correlation and prediction results, we calculated the brain resels for each smoothing parcellation parameter. Result Figure 1.A shows the correlation patterns across the brain as a function of smoothing and parcellation. Figure 2 shows age prediction error as a function of smoothing kernel, parcellation level, and number of principal components included. Larger smoothing kernels and brain parcels result in higher correlation values (Figure 1.B), but lower prediction accuracy (Figure 2). Figures 3.A and 3.B show mean age‐correlation value and age‐prediction error as a function of number of resels. Conclusion Our results demonstrate an opposite relationship between brain‐age association values and brain‐age prediction accuracy, and quantify how smoothing and parcellation parameters affect each of these analyses. These results highlight the importance of parameter selection for each analysis type and how they might affect the final results, and have significant implications for brain aging studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,073
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,165
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,385

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0730,165
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0040,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
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