Patterns of eukaryotic diversity from the surface to the deep-ocean sediment
Notice bibliographique
Résumé
Remote deep-ocean sediment (DOS) ecosystems are among the least explored biomes on Earth. Genomic assessments of their biodiversity have failed to separate indigenous benthic organisms from sinking plankton. Here, we compare global-scale eukaryotic DNA metabarcoding datasets (18 S -V9) from abyssal and lower bathyal surficial sediments and euphotic and aphotic ocean pelagic layers to distinguish plankton from benthic diversity in sediment material. Based on 1685 samples collected throughout the world ocean, we show that DOS diversity is at least threefold that in pelagic realms, with nearly two-thirds represented by abundant yet unknown eukaryotes. These benthic communities are spatially structured by ocean basins and particulate organic carbon (POC) flux from the upper ocean. Plankton DNA reaching the DOS originates from abundant species, with maximal deposition at high latitudes. Its seafloor DNA signature predicts variations in POC export from the surface and reveals previously overlooked taxa that may drive the biological carbon pump.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,007 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».