MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4210413950 · doi:10.1126/sciadv.abj9309

Patterns of eukaryotic diversity from the surface to the deep-ocean sediment

2022· article· en· W4210413950 sur OpenAlexaff
Tristan Cordier, Inès Barrenechea Angeles, Nicolas Henry, Franck Lejzerowicz, Cédric Berney, Raphaël Morard, Angelika Brandt, Marie‐Anne Cambon‐Bonavita, Lionel Guidi, Fabien Lombard, Pedro Martínez Arbizu, Ramón Massana, Covadonga Orejas, Julie Poulain, Craig R. Smith, Patrick Wincker, Sophie Arnaud‐Haond, Andrew J. Gooday, Colomban de Vargas, Jan Pawłowski

Notice bibliographique

RevueScience Advances · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensCytodiagnostics (Canada)
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBathyal zoneBenthic zonePlanktonOceanographyPhotic zonePelagic zoneSediment trapDeep seaEnvironmental scienceBiodiversitySedimentEcologyGeologyBiologyPhytoplanktonPaleontologyWater column

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Remote deep-ocean sediment (DOS) ecosystems are among the least explored biomes on Earth. Genomic assessments of their biodiversity have failed to separate indigenous benthic organisms from sinking plankton. Here, we compare global-scale eukaryotic DNA metabarcoding datasets (18 S -V9) from abyssal and lower bathyal surficial sediments and euphotic and aphotic ocean pelagic layers to distinguish plankton from benthic diversity in sediment material. Based on 1685 samples collected throughout the world ocean, we show that DOS diversity is at least threefold that in pelagic realms, with nearly two-thirds represented by abundant yet unknown eukaryotes. These benthic communities are spatially structured by ocean basins and particulate organic carbon (POC) flux from the upper ocean. Plankton DNA reaching the DOS originates from abundant species, with maximal deposition at high latitudes. Its seafloor DNA signature predicts variations in POC export from the surface and reveals previously overlooked taxa that may drive the biological carbon pump.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,007
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations111
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScience AdvancesMême sujetEnvironmental DNA in Biodiversity StudiesTravaux en français237 207