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Enregistrement W4210423138 · doi:10.1007/s11568-009-9084-7

Chemical genomics and molecular medicine

2008· article· en· W4210423138 sur OpenAlexaff
R Ramanan, Biplab Bhattacharjee, Amit Kumar, Zahra Hassan, Kumar Jeevan, M. Suresh, M Saleem Farooqi, Prabhat Arya, Pratibha Nallari, T Tanjore, Maithili V. N. Dokuparti, Urooge Boda, P Pranati, Advithi Rangaraju, P Kelkar, R. K. Jain, C. Narsimhan

Notice bibliographique

RevueGenomic Medicine · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBiotechnology and Related Fields
Établissements canadiensSteacie Institute for Molecular SciencesOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenomicsGenomic medicineComputational biologyBiologyGeneticsGenomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disease that, in its most common form, occurs as dementia in people over 65 years old although early onset form also exists.Currently it afflicts 24 million people worldwide.The disease is characterized in the brain by abnormal clumps (amyloid plaques) and tangled bundles of fibers (neurofibrillary tangles) composed of misplaced proteins.Three neurotransmitters commonly affected by AD are acetylcholine, serotonin, and nor epinephrine.The cholinergic system-the nerve cell system in the brain that uses acetylcholine as a neurotransmitter-is the most dramatic of the neurotransmitter systems affected by Alzheimer's disease.Acetylcholinesterase is one of the most crucial enzymes that hydrolyze acetylcholine in the brain to choline and acetic acid at cholinergic synapses, leading to nerve response and function.Potentiation of central cholinergic activity has been proposed as a therapeutic approach for improving the cognitive function in patients with Alzheimer's disease (AD).Increasing the acetylcholine concentration in the brain by modulating/inhibiting acetylcholinesterase (AchE) activity is among the most promising therapeutic strategies.In our studies attempts were made to produce potential natural acetylcholinesterase inhibitors.More than eight hundred compounds were taken from different natural sources.Initial in-silico screening of molecules was based on docking score between acetylcholinesterase and compounds taken from the natural sources.The hits were further analyzed and narrowed by applying Lipinski's rule-of-five analysis.Molecules with high ability to cross blood brain barrier were taken for energy minimization and quantitative structure activity studies.The biological activity of promising compounds was predicted by using PASS prediction analysis.Ferulic acid and Caffeic acid found in garlic showed very good IC50 values and satisfied the standard drug-like properties with remarkable pharmacokinetics and pharmacodynamics abilities.Thus we hypothesize that ferulic acid and caffeic acid which is obtained from garlic can be used as an effective acetylcholinesterase inhibitors in the early stage of Alzheimer's disease.Wet lab studies were conducted on the Swiss Albino mice as the animal model to check the inhibition of acetycholinestrerase by ferulic acid and caffeic acid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,107

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0320,020

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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