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Enregistrement W4210447105 · doi:10.3389/fnagi.2021.708932

Genetic Algorithms for Optimized Diagnosis of Alzheimer’s Disease and Frontotemporal Dementia Using Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography Imaging

2022· article· en· W4210447105 sur OpenAlexfundno aff
Josefa Díaz‐Álvarez, Jordi A. Matías‐Guiu, María Nieves Cabrera‐Martín, Vanesa Pytel, Ignacio Segovia-Ríos, Fernando García‐Gutiérrez, Laura Hernández‐Lorenzo, José Luis Carreras, José L. Ayala

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Aging Neuroscience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingAgencia Estatal de InvestigaciónEuropean Regional Development FundInstituto de Salud Carlos IIICanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SServierEisaiGenentechIXICOBristol-Myers SquibbMinisterio de Economía y CompetitividadMinisterio de Ciencia e InnovaciónNorthern California Institute for Research and EducationF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaPfizerBioClinicaBiogenEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationAlzheimer's Association
Mots-clésFrontotemporal dementiaPositron emission tomographyPrimary progressive aphasiaDementiaFluorodeoxyglucoseAlgorithmDifferential diagnosisNeuroimagingArtificial intelligenceComputer scienceMedicineDiseasePsychologyMachine learningNeurosciencePathologyNuclear medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic algorithms have a proven capability to explore a large space of solutions, and deal with very large numbers of input features. We hypothesized that the application of these algorithms to 18F-Fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography (FDG-PET) may help in diagnosis of Alzheimer’s disease (AD) and Frontotemporal Dementia (FTD) by selecting the most meaningful features and automating diagnosis. We aimed to develop algorithms for the three main issues in the diagnosis: discrimination between patients with AD or FTD and healthy controls (HC), differential diagnosis between behavioral FTD (bvFTD) and AD, and differential diagnosis between primary progressive aphasia (PPA) variants. Genetic algorithms, customized with K-Nearest Neighbor and BayesNet Naives as the fitness function, were developed and compared with Principal Component Analysis (PCA). K-fold cross validation within the same sample and external validation with ADNI-3 samples were performed. External validation was performed for the algorithms distinguishing AD and HC. Our study supports the use of FDG-PET imaging, which allowed a very high accuracy rate for the diagnosis of AD, FTD, and related disorders. Genetic algorithms identified the most meaningful features with the minimum set of features, which may be relevant for automated assessment of brain FDG-PET images. Overall, our study contributes to the development of an automated, and optimized diagnosis of neurodegenerative disorders using brain metabolism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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