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Enregistrement W4210468311 · doi:10.1126/science.abe8457

Discovery of genomic loci of the human cerebral cortex using genetically informed brain atlases

2022· article· en· W4210468311 sur OpenAlexfundno aff
Carolina Makowski, Dennis van der Meer, Weixiu Dong, Hao Wang, Yan Wu, Jingjing Zou, Cin Liu, Donald J. Hagler, Chun Chieh Fan, William S. Kremen, Ole A. Andreassen, Terry L. Jernigan, Anders M. Dale, Kun Zhang, Peter M. Visscher, Jian Yang, Chi‐Hua Chen

Notice bibliographique

RevueScience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBioinformatics and Genomic Networks
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Health and Medical Research CouncilNational Institute of Mental HealthMedical Research CouncilFonds de Recherche du Québec - SantéUniversity of California, San DiegoNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute on Drug AbuseNorges Forskningsråd
Mots-clésBiologyCerebral cortexComputational biologyHuman brainNeuroscienceGenetically modified organismNeuroimagingGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To determine the impact of genetic variants on the brain, we used genetically informed brain atlases in genome-wide association studies of regional cortical surface area and thickness in 39,898 adults and 9136 children. We uncovered 440 genome-wide significant loci in the discovery cohort and 800 from a post hoc combined meta-analysis. Loci in adulthood were largely captured in childhood, showing signatures of negative selection, and were linked to early neurodevelopment and pathways associated with neuropsychiatric risk. Opposing gradations of decreased surface area and increased thickness were associated with common inversion polymorphisms. Inferior frontal regions, encompassing Broca's area, which is important for speech, were enriched for human-specific genomic elements. Thus, a mixed genetic landscape of conserved and human-specific features is concordant with brain hierarchy and morphogenetic gradients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,193
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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