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Enregistrement W4210554583 · doi:10.4337/9781839105951.00020

US FEDERAL GENOMIC DATA RELEASE AND ACCESS POLICIES

2022· book-chapter· en· W4210554583 sur OpenAlexaboutno aff
Jorge L. Contreras

Notice bibliographique

RevueEdward Elgar Publishing eBooks · 2022
Typebook-chapter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésDownloadGenetic dataData scienceGenomeData accessQuarter (Canadian coin)Human genomeWorld Wide WebComputer scienceBiologyGeographyDatabaseGeneticsGeneSociologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Researchers today have access to a vast aggregation of human and nonhuman genomic data, largely on an open access basis. According to the Joint Genome Institute's Genomes OnLine Database (GOLD), data from more than 40,000 sequencing projects around the world, representing more than 375,000 different organisms, were publicly available to researchers as of July 2020. The availability of this tremendous public resource is due, in large part, to the data release policies developed a quarter century ago, toward the beginning of the Human Genome Project (HGP), which have been carried forward, in modified form, to the present. These policies impose requirements on both the generators of data (typically the sequencing centers and other laboratories conducting genetic experiments) and the users of that data (that is, researchers who download and/or use it). This article, briefly outlines the history of such data release policies, particularly in the US and with respect to human genomic data, and provides an overview of the obligations imposed on both data generators and data users.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,998
Score d'incertitude au seuil0,143

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,006
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0050,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0430,035

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,425
Tête enseignante GPT0,484
Écart entre enseignants0,059 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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