Allopatric speciation rather than ecological speciation drives evolution in an Amazonian fish.
Notice bibliographique
Résumé
Amazonia is characterized by very heterogeneous riverscapes dominated by two drastically divergent water types: black (ion-poor, dissolved organic carbonate rich and acidic) and white (nutrient rich and turbid) waters. Recent phylogeographic and genomic studies have associated the ecotone formed by these environments to ecologically driven speciation in fishes. With the objective of better understanding the evolutionary forces behind the Amazonian Teleostean diversification, we sampled 240 Mesonauta festivus from 12 sites on a wide area of the Amazonian basin. These sites included three confluences of black and white water environments to seek for repeated evidences of ecological speciation at these ecotones. Results obtained through our genetic assessment based on 41,268 SNPs contrast with previous findings and supports a low structuring power of water types. Conversely, we detected a strong pattern of isolation by unidirectional downstream water current and evidence of past events of vicariance potentially linked to the Amazon River formation. Using a combination of population genetic, phylogeographic analysis and environmental association models, we decomposed the spatial variance from the environmental genetic variance specifically to assess which evolutive forces have shaped inter-population differences in M. festivus ’ genome. Our sampling design comprising four major Amazonian rivers and three confluences of black and white water rivers supports the possibility that past studies potentially confounded ecological speciation with a site effect unrepresentative of the full Amazonian watershed. While ecological speciation admittedly played a role in Amazonian fish species diversification, we argue that neutral evolutionary processes explain most of the divergence between M. festivus populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».