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Enregistrement W4210633927 · doi:10.7717/peerj.12866

<i>C. elegans</i> as an <i>in vivo</i> model system for the phenotypic drug discovery for treating paraquat poisoning

2022· article· en· W4210633927 sur OpenAlexaff
Peng Ji, Hongyuan Li, Yushan Jin, Yinghua Peng, Lihui Zhao, Xiaohui Wang

Notice bibliographique

RevuePeerJ · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParaquat toxicity studies and treatments
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBeijing National Laboratory for Molecular SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésParaquatPharmacologyReactive oxygen speciesToxicologyBiologyMalondialdehydePhenotypeCaenorhabditis elegansAntioxidantBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Paraquat (PQ) is an effective and widely used herbicide and causes numerous fatalities by accidental or voluntary ingestion. However, neither the final cytotoxic mechanism nor effective treatments for PQ poisoning have been discovered. Phenotypic drug discovery (PDD), which does not rely on the molecular mechanism of the diseases, is having a renaissance in recent years owing to its potential to address the incompletely understood complexity of diseases. Herein, the C. elegans PDD model was established to pave the way for the future phenotypic discovery of potential agents for treating PQ poisoning. Methods C. elegans were treated with PQ-containing solid medium followed by statistical analysis of worm survival, pharyngeal pumping, and movement ability. Furthermore, coenzyme Q10 (CoQ10) was used to test the C. elegans model of PQ poisoning by measuring the levels of reactive oxygen species (ROS) and malondialdehyde (MDA), mitochondrial morphology, and worm survival rate. Additionally, we used the classic mice model of PQ intoxication to evaluate the validity of the C. elegans model of PQ poisoning by measuring the effect of CoQ10 as a potential antidote for PQ poisoning. Results In the C. elegans model of PQ poisoning, 5 mg/mL PQ increased the levels of ROS, MDA content, mitochondrial fragments, which significantly shortened the lifespan, while CoQ10 alleviated these phenotypes. In the mice model of PQ poisoning, CoQ10 increased the chance of survival in PQ poisoned mice while reducing ROS, MDA content in lung tissue and inhibiting PQ-induced lung edema. Moreover, CoQ10 alleviated the lung morphopathological changes induced by PQ. Conclusion Here we established a C. elegans model of PQ poisoning, whose validity was confirmed by the classic mice model of PQ intoxication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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