Increasing the Efficiency of Canola and Soybean GMO Detection and Quantification Using Multiplex Droplet Digital PCR
Notice bibliographique
Résumé
The number of genetically modified (GM) events for canola, maize, and soybean has been steadily increasing. Real-time PCR is widely used for the detection and quantification of individual GM events. Digital PCR (dPCR) has also been used for absolute quantification of GM events. A duplex dPCR assay consisting of one reference gene and one GM event has been carried out in most cases. The detection of more than one GM event in a single assay will increase the efficiency of dPCR. The feasibility of detection and quantification of two, three, and four GM canola and soybean events at the same time was investigated at 0.1%, 1%, and 5% levels using the QX200 Droplet Digital PCR (ddPCR) system. The reference gene assay was carried out on the same plate but in different wells. For some of the assays, optimization of the probe concentrations and labels was needed for successful ddPCR. Results close to the expected result were achieved for duplex, triplex, and tetraplex ddPCR assays for GM canola events. Similar ddPCR results were also achieved for some GM soybean events with some exceptions. Overall, absolute quantification of up to four GM events at the same time improves the efficiency of GM detection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».