MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4210676595 · doi:10.3390/v14020291

Poly(rC)-Binding Protein 1 Limits Hepatitis C Virus Virion Assembly and Secretion

2022· article· en· W4210676595 sur OpenAlexafffund
Sophie Cousineau, Marylin Rheault, Selena M. Sagan

Notice bibliographique

RevueViruses · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchDalhousie UniversityUniversity of AlbertaCanada Research ChairsMcGill University
Mots-clésVirologySecretionVirusHepatitis C virusChemistryBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The hepatitis C virus (HCV) co-opts numerous cellular elements, including proteins, lipids, and microRNAs, to complete its viral life cycle. The cellular RNA-binding protein, poly(rC)-binding protein 1 (PCBP1), was previously reported to bind to the 5' untranslated region (UTR) of the HCV genome; however, its importance in the viral life cycle has remained unclear. Herein, we sought to clarify the role of PCBP1 in the HCV life cycle. Using the HCV cell culture (HCVcc) system, we found that knockdown of endogenous PCBP1 resulted in an overall decrease in viral RNA accumulation, yet resulted in an increase in extracellular viral titers. To dissect PCBP1's specific role in the HCV life cycle, we carried out assays for viral entry, translation, genome stability, RNA replication, as well as virion assembly and secretion. We found that PCBP1 knockdown did not directly affect viral entry, translation, RNA stability, or RNA replication, but resulted in an overall increase in infectious particle secretion. This increase in virion secretion was evident even when viral RNA synthesis was inhibited, and blocking virus secretion could partially restore the viral RNA accumulation decreased by PCBP1 knockdown. We therefore propose a model where endogenous PCBP1 normally limits virion assembly and secretion, which increases viral RNA accumulation in infected cells by preventing the departure of viral genomes packaged into virions. Overall, our findings improve our understanding of how cellular RNA-binding proteins influence viral genomic RNA utilization during the HCV life cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,322
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueVirusesMême sujetHepatitis C virus researchTravaux en français237 207