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Enregistrement W4210713159 · doi:10.3998/ptpbio.2103

Costs, Benefits, Parasites and Mutualists: The Use and Abuse of the Mutualism–Parasitism Continuum Concept for “Epichloë” Fungi

2022· article· en· W4210713159 sur OpenAlexafffund
Jonathan A. Newman, Sierra Gillis, Heather A. Hager

Notice bibliographique

RevuePhilosophy Theory and Practice in Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and fungal interactions
Établissements canadiensWilfrid Laurier University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsWilfrid Laurier University
Mots-clésMutualism (biology)ParasitismBiologyEpichloëEndophyteEcologyConfusionSymbiosisEvolutionary biologyBotanyHost (biology)PaleontologyPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The species comprising the fungal endophyte genus Epichloë are symbionts of cool season grasses. About half the species in this genus are strictly vertically transmitted, and evolutionary theory suggests that these species must be mutualists. Nevertheless, Faeth and Sullivan (e.g., 2003) have argued that such vertically transmitted endophytes are “usually parasitic,” and Müller and Krauss (2005) have argued that such vertically transmitted endophytes fall along a mutualism-parasitism continuum. These papers (and others) have caused confusion in the field. We used a systematic review to show that close to half of the published papers in this field incorrectly categorize the interaction. Here, we develop the argument that advantages and disadvantages are not the same things as mutualism and parasitism and that experimental evidence must be interpreted in the context of theory. We argue that, contra Faeth and Sullivan, it is highly unlikely that such strictly vertically transmitted endophytes can be parasites, and that, contra Müller and Krauss, it is inappropriate to apply the continuum concept to strictly vertically transmitted endophytes. We develop a mathematical model to support and illustrate our arguments. We use the model to clarify that parasitism requires some degree of horizontal transmission, and that while it is appropriate to use the continuum concept when referring to the genus as a whole, or to species that possess horizontal transmission, we argue that it is inappropriate to use the concept when referring to species that are strictly vertically transmitted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,611
Score d'incertitude au seuil0,392

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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