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Enregistrement W4210753414 · doi:10.1094/pdis-09-21-1993-re

Identification of Putative SDHI Target Site Mutations in the SDHB, SDHC, and SDHD Subunits of the Grape Powdery Mildew Pathogen <i>Erysiphe necator</i>

2022· article· en· W4210753414 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFungal Plant Pathogen Control
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureAmerican Vineyard Foundation
Mots-clésSDHDSDHBBiologyMissense mutationGeneticsMutationGeneGermline mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Succinate dehydrogenase inhibitors (SDHIs) are fungicides used in control of numerous fungal plant pathogens, including Erysiphe necator, the causal agent of grapevine powdery mildew (GPM). Here, the sdhb, sdhc, and sdhd genes of E. necator were screened for mutations that may be associated with SDHI resistance. GPM samples were collected from 2017 to 2020 from the U.S. states of California, Oregon, Washington, and Michigan, and the Canadian province of British Columbia. Forty-five polymorphisms were identified in the three sdh genes, 17 of which caused missense mutations. Of these, the SDHC-p.I244V substitution was shown in this study to reduce sensitivity of E. necator to boscalid and fluopyram, whereas the SDHC-p.G25R substitution did not affect SDHI sensitivity. Of the other 15 missense mutations, the SDHC-p.H242R substitution was shown in previous studies to reduce sensitivity of E. necator toward boscalid, whereas the equivalents of the SDHB-p.H242L, SDHC-p.A83V, and SDHD-p.I71F substitutions were shown to reduce sensitivity to SDHIs in other fungi. Generally, only a single amino acid substitution was present in the SDHB, SDHC, or SDHD subunit of E. necator isolates, but missense mutations putatively associated with SDHI resistance were widely distributed in the sampled areas and increased in frequency over time. Finally, isolates that had decreased sensitivity to boscalid or fluopyram were identified but with no or only the SDHC-p.G25R amino acid substitution present in SDHB, SDHC, and SDHD subunits. This suggests that target site mutations probably are not the only mechanism conferring resistance to SDHIs in E. necator.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,914
Score d'incertitude au seuil0,236

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle