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Enregistrement W4210782573 · doi:10.1038/s41378-021-00348-w

Modeling and measuring glucose diffusion and consumption by colorectal cancer spheroids in hanging drops using integrated biosensors

2022· article· en· W4210782573 sur OpenAlexfundno aff
Nassim Rousset, Rubén López Sandoval, Mario M. Modena, Andreas Hierlemann, Patrick M. Misun

Notice bibliographique

RevueMicrosystems & Nanoengineering · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMicrofluidic and Capillary Electrophoresis Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFundación Bancaria Caixa d'Estalvis i Pensions de BarcelonaEidgenössische Technische Hochschule Zürich“la Caixa” FoundationUniversität Basel
Mots-clésGlucose oxidaseBiosensorMicroscale chemistryChemistrySpheroidAnalyteNanotechnologyBiophysicsMicroelectrodeMaterials scienceBiochemistryElectrodeChromatographyIn vitroBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract As 3D in vitro tissue models become more pervasive, their built-in nutrient, metabolite, compound, and waste gradients increase biological relevance at the cost of analysis simplicity. Investigating these gradients and the resulting metabolic heterogeneity requires invasive and time-consuming methods. An alternative is using electrochemical biosensors and measuring concentrations around the tissue model to obtain size-dependent metabolism data. With our hanging-drop-integrated enzymatic glucose biosensors, we conducted current measurements within hanging-drop compartments hosting spheroids formed from the human colorectal carcinoma cell line HCT116. We developed a physics-based mathematical model of analyte consumption and transport, considering (1) diffusion and enzymatic conversion of glucose to form hydrogen peroxide (H2O2) by the glucose-oxidase-based hydrogel functionalization of our biosensors at the microscale; (2) H2O2 oxidation at the electrode surface, leading to amperometric H2O2 readout; (3) glucose diffusion and glucose consumption by cancer cells in a spherical tissue model at the microscale; (4) glucose and H2O2 transport in our hanging-drop compartments at the macroscale; and (5) solvent evaporation, leading to glucose and H2O2 upconcentration. Our model relates the measured currents to the glucose concentrations generating the currents. The low limit of detection of our biosensors (0.4 ± 0.1 μM), combined with our current-fitting method, enabled us to reveal glucose dynamics within our system. By measuring glucose dynamics in hanging-drop compartments populated by cancer spheroids of various sizes, we could infer glucose distributions within the spheroid, which will help translate in vitro 3D tissue model results to in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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