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Enregistrement W4210859759 · doi:10.1016/j.biopha.2022.112684

A pharmacogenomic investigation of the cardiac safety profile of ondansetron in children and pregnant women

2022· article· en· W4210859759 sur OpenAlexafffund
Britt I. Drögemöller, Galen E.B. Wright, Jessica N. Trueman, Kaitlyn Shaw, Michelle Staub, Shahnaz Chaudhry, Fudan Miao, Michelle Higginson, Gabriella Groeneweg, J Brown, Laura A. Magee, Simon D. Whyte, Nicholas West, Sonia M. Brodie, Geert ‘t Jong, Sara J. Israels, Howard Berger, Shinya Ito, Shahrad R. Rassekh, Shubhayan Sanatani, Colin J.D. Ross, Bruce Carleton

Notice bibliographique

RevueBiomedicine & Pharmacotherapy · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNausea and vomiting management
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalB.C. Women's Hospital & Health CentreUniversity of British ColumbiaHospital for Sick ChildrenChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of ManitobaBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BC
Mots-clésOndansetronMedicineAntiemeticPharmacogenomicsAdverse effectPharmacogeneticsCohortAnesthesiaNauseaQT intervalInternal medicinePharmacologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ondansetron is a highly effective antiemetic for the treatment of nausea and vomiting. However, this medication has also been associated with QT prolongation. Pharmacogenomic information on therapeutic response to ondansetron exists, but no investigation has been performed on genetic factors that influence the cardiac safety of this medication. Three patient groups receiving ondansetron were recruited and followed prospectively (pediatric post-surgical patients n = 101; pediatric oncology patients n = 98; pregnant women n = 62). Electrocardiograms were conducted at baseline, and 5- and 30-min post-ondansetron administration, to determine the effect of ondansetron treatment on QT interval. Pharmacogenomic associations were assessed via analyses of comprehensive CYP2D6 genotyping and genome-wide association study data. In the entire cohort, 62 patients (24.1%) met the criteria for prolonged QT, with 1.2% of the cohort exhibiting unsafe QT prolongation. The most significant shift from baseline occurred at five minutes post-ondansetron administration (P = 9.8 × 10−4). CYP2D6 activity score was not associated with prolonged QT. Genome-wide analyses identified novel associations with a missense variant in TLR3 (rs3775291; P = 2.00 × 10−7) and a variant linked to the expression of SLC36A1 (rs34124313; P = 1.97 × 10−7). This study has provided insight into the genomic basis of ondansetron-induced cardiac changes and has emphasized the importance of genes that have been implicated in serotonin-related traits. These biologically-relevant findings represent the first step towards understanding this adverse event with the overall goal to improve the safety of this commonly used antiemetic medication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,494
Score d'incertitude au seuil0,373

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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