Understanding the dynamics of SARS-CoV-2 variants of concern in Ontario, Canada: a modeling study
Notice bibliographique
Résumé
A year after the initial wild-type Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) strains began their devastation of the world, they were supplanted by new variants of concern (VOC). In Ontario, Canada, the wild type was overtaken first by the Alpha/B1.1.17 variant, and then by the Delta/B.1.617 variant. The principal objective of the present study is to develop and apply a much expanded Susceptible-Infection-Recovered-type model to better understand the spread of multiple VOC, and assess the effectiveness of vaccination and non-pharmaceutical interventions (NPI). The model represents competition among VOC, and reveals their mutual inhibitory effects. By separately tracking asymptomatic and symptomatic infections, model simulations identify a significant role of vaccine breakthrough in the spread of Delta. Furthermore, the severity of a Delta outbreak depends not only on the NPI and vaccination rate but also on the vaccine types. Alarmingly, despite Ontario's existing NPI and relatively successful vaccine rollout, a future, more dangerous VOC could potentially infect a significant fraction of the province's population and overwhelm the health care system. To stop that VOC, the province may need the simultaneous and rapid deployment of a third booster vaccine and stringent NPI.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».