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Enregistrement W4210929754 · doi:10.3410/f.1031864.371963

Faculty Opinions recommendation of Variation in factor B (BF) and complement component 2 (C2) genes is associated with age-related macular degeneration.

2006· dataset· en· W4210929754 sur OpenAlexfundno aff
John P. Atkinson

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2006
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Diseases and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesQueen's UniversityMacula FoundationRetina Research FoundationResearch to Prevent BlindnessNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésHaplotypeMacular degenerationFactor HGeneticsOdds ratioAlleleGeneComplement factor BGenetic variationComplement component 3BiologyComplement factor IGenetic variantsMedicineComplement systemGenotypeAlternative complement pathwayInternal medicineAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Age-related macular degeneration (AMD) is the most common form of irreversible blindness in developed countries 1,2 .Variants in the factor H gene (CFH, also known as HF1), which encodes a major inhibitor of the alternative complement pathway, are associated with the risk for developing AMD [3][4][5][6][7][8] .Here we test the hypothesis that variation in genes encoding other regulatory proteins of the same pathway is associated with AMD.We screened factor B (BF) and complement component 2 (C2) genes, located in the major histo-compatibility complex class III region, for genetic variation in two independent cohorts comprising ~900 individuals with AMD and ~400 matched controls.Haplotype analyses identify a statistically significant common risk haplotype (H1) and two protective haplotypes.The L9H variant of BF and the E318D variant of C2 (H10), as well as a variant in intron 10 of C2 and the R32Q variant of BF (H7), confer a significantly reduced risk of AMD (odds ratio = 0.45 and 0.36, respectively).Combined analysis of the C2 and BF haplotypes and CFH variants shows that variation in the two loci can predict the clinical outcome in 74% of the affected individuals and 56% of the controls.These data expand and refine our understanding of the genetic risk for AMD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,021
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,341
Score d'incertitude au seuil0,940

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,021
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3410,124

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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