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Enregistrement W4210975419 · doi:10.33314/jnhrc.v19i3.3421

KRAS Oncogene Mutations in Colorectal Cancer Patients in a Nepalese Tertiary Care Hospital

2021· article· en· W4210975419 sur OpenAlexaff
Bhupendra Kumar Basnet, Balram Gautam, Kamal Ranabhat, Bishnu Dutta Paudel, Sandhya Chapagain Acharya, Sri Ram Bastola, Bishal Gyawali

Notice bibliographique

RevueJournal of Nepal Health Research Council · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Treatments and Studies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésViral OncogeneKRASMedicineOncogeneColorectal cancerCancerSarcomaMutationPoint mutationCancer researchOncologyInternal medicinePathologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Colorectal cancer is one of the most common cancers in the world and ranks among top ten cancer in Nepal. Limited data have been reported in the literature regarding the prevalence of Kristen Rat Sarcoma viral oncogene mutation in Nepalese patients with colorectal cancer. In a low income country such as Nepal where majority of cancer patient pay for treatment out-of-pocket, it is important to ascertain Kristen Rat Sarcoma viral oncogene mutation status before starting treatment with these agents. METHODS: We analysed 22 colorectal cancer specimens diagnosed histopathologically. Real Time Polymerase Chain Reaction was performed on extracted DNA using RoterGene from Qiagen. US Food and Drug Administration approved kit was used for detection of Kristen Rat Sarcoma viral oncogene mutation i.e. TheraScreen: K-RAS Mutation Kit: The K-RAS Kit detects seven Kristen Rat Sarcoma viral oncogene mutations in codons 12 and 13 of the Kristen Rat Sarcoma viral oncogene. RESULTS: Kristen Rat Sarcoma viral oncogene mutation was observed in 13 (59%) of the samples studied. All samples had point mutation on codons 12 while 5 samples (38%) also had a point mutation on codons 13. No association was found between the presence of Kristen Rat Sarcoma viral oncogene mutation and gender or age or sidedness of the cancer. CONCLUSIONS: Kristen Rat Sarcoma viral oncogene was commonly present in colorectal cancer specimens. Further efforts towards establishment of diagnostic test, generation of new database, development and scale up of laboratory services are needed throughout the nation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,432
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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