MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4210981398 · doi:10.24124/2020/59111

Evolutionary and functional characterization of oxidative stress proteins in dendroctonus ponderosae hopkins (curculionidae: scolytinae)

2020· dissertation· en· W4210981398 sur OpenAlexaff
Luke Spooner

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect and Pesticide Research
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of Northern British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSuperoxide dismutasePeroxiredoxinOxidative stressCatalaseBiologyReactive oxygen speciesBiochemistryPeroxidaseCell biologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding the mountain pine beetle detoxification systems is vital for predicting its continued spread into the novel jack pine host. Phylogenetic analyses were conducted for mountain pine beetle catalase, glutathione peroxidase, superoxide dismutase, and peroxiredoxin. These proteins were generally conserved, but there were differences in some key functional motifs. Specifically, a peroxiredoxin (DPPrx1) contained a unique combination of hyperoxidation motifs. DPPrx1 and a superoxide dismutase (DPSOD1) were selected for further functional analyses and demonstrated higher reactivity when compared to other SOD and Prx proteins. Also, DPPrx1 experiences hyperoxidation at a lower H2O2 concentration (~0.06 mM) than human peroxiredoxin (~0.12 mM). In other systems, hyperoxidized peroxiredoxin does act as a signal molecule for the expression of other oxidative stress proteins. Therefore, due to its relatively high reactivity and potential role as a cellular signal, DPPrx1 could serve as a future pest management target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetInsect and Pesticide ResearchTravaux en français237 207