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Enregistrement W4211013374 · doi:10.7287/peerj.5914v0.2/reviews/2

Peer Review #2 of "Characteristics of the complete mitochondrial genome of Suhpalacsa longialata (Neuroptera, Ascalaphidae) and its phylogenetic implications (v0.2)"

2018· peer-review· en· W4211013374 sur OpenAlexaff
Xinyan Gao, Yin-Yin Cai, Dan‐Na Yu, Kenneth B. Storey, Jia‐Yong Zhang

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFossil Insects in Amber
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuropteraPhylogenetic treeBiologyMitochondrial DNAEvolutionary biologyZoologyGeneticsPaleontologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The owlflies (Family Ascalaphidae) belong to the Neuroptera but are often mistaken as dragonflies because of morphological characters.To date, only three mitochondrial genomes of Ascalaphidae, namely Libelloides macaronius; Ascaloptynx appendiculatus; Ascalohybris subjacens, are published in GenBank, meaning that they are greatly underrepresented in comparison with the 430 described species reported in this family.In this study, we sequenced and described the complete mitochondrial genome of Suhpalacsa longialata (Neuroptera, Ascalaphidae).The total length of the S. longialata mitogenome was 15,911 bp, which is the longest known to date among the available family members of Ascalaphidae.However, the size of each gene was similar to the other three Ascalaphidae species.The S. longialata mitogenome included a transposition of tRNACys and tRNATrp genes and formed an unusual gene arrangement tRNA Cys -tRNA Trp -tRNA Tyr (CWY) .It is likely that the transposition occurred by a duplication of both genes followed by random loss of partial duplicated genes.The nucleotide composition of the S. longialata mitogenome was as follows: A=41.0%,T=33.8%,C=15.5%,G=9.7%.Both BI and ML analyses strongly supported S. longialata as a sister clade to (Ascalohybris subjacens + L. macaronius), and indicated that Ascalaphidae is not monophyletic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,032
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,514
Score d'incertitude au seuil0,693

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,032
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0070,004
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,5140,392

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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