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Enregistrement W4211053972 · doi:10.1107/s010876732109005x

Structural characterization of missense mutation identified in BRCA2 using comparative biophysical and dynamics studies

2021· article· en· W4211053972 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Bioinformatics, and Biomedical Research
Établissements canadiensUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationBiologyGeneticsMutantHomologous recombinationMutationDNAComputational biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breast cancer type 2 susceptibility (BRCA2) protein plays an essential role in the repair of DNA double-strand breaks and interstrand cross-links by Homologous recombination [1].Germ-line mutations in BRCA2 confer an increased risk of hereditary breast and ovarian cancer [2].A large number of missense mutations have been identified in the DNA binding carboxy-terminal domain of BRCA2 which is also known to interact with FANCD2 [3].However, majority of these missense mutations are classified as variants of 'Uncertain Significance' due to lack of structural, functional, and clinical studies.Accurate and reliable methods to predict the pathogenicity of variants are utmost required for better clinical management of the disease.Here we present a multi-disciplinary approach to characterize a missense mutation identified in the C-terminal domain of BRCA2.Different functional domains of the wild-type and mutant BRCA2 protein were cloned and the proteins were expressed and purified in bacterial system.Circulardichroism and Fluorescence spectroscopic techniques were employed to evaluate the differences between secondary and tertiary structures of wild-type and mutant protein.Molecular Dynamics Simulation was further utilized to measure the effect of mutations on the structural conformation of the protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,846
Score d'incertitude au seuil0,333

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle