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Enregistrement W4211173190 · doi:10.1016/j.epidem.2022.100547

Challenges in estimation, uncertainty quantification and elicitation for pandemic modelling

2022· article· en· W4211173190 sur OpenAlexaff
Ben Swallow, Paul Birrell, Joshua Blake, Mark A. Burgman, Peter Challenor, Luc E. Coffeng, A. P. Dawid, Daniela De Angelis, Michael Goldstein, Victoria Hemming, Glenn Marion, Trevelyan J. McKinley, Christopher E. Overton, Jasmina Panovska‐Griffiths, Lorenzo Pellis, Will Probert, Katriona Shea, Daniel Antunes Maciel Villela, Ian Vernon

Notice bibliographique

RevueEpidemics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesDivision of Mathematical SciencesResearch EnglandMedical Research CouncilNational Science FoundationRoyal SocietyEngineering and Physical Sciences Research CouncilUK Research and InnovationAlan Turing InstituteRural and Environment Science and Analytical Services DivisionScottish GovernmentConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoZonMwIsaac Newton Institute for Mathematical SciencesWellcome Trust
Mots-clésEstimationPandemicComputer scienceInferenceJudgementCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Data scienceInfectious disease (medical specialty)Expert elicitationPoint estimationUncertainty quantification2019-20 coronavirus outbreakRisk analysis (engineering)Data miningMachine learningArtificial intelligenceDiseaseMedicineStatisticsEngineeringPolitical scienceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The estimation of parameters and model structure for informing infectious disease response has become a focal point of the recent pandemic. However, it has also highlighted a plethora of challenges remaining in the fast and robust extraction of information using data and models to help inform policy. In this paper, we identify and discuss four broad challenges in the estimation paradigm relating to infectious disease modelling, namely the Uncertainty Quantification framework, data challenges in estimation, model-based inference and prediction, and expert judgement. We also postulate priorities in estimation methodology to facilitate preparation for future pandemics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,108
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,266
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil0,571

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1080,266
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0020,009
Communication savante0,0100,015
Science ouverte0,0040,008
Intégrité de la recherche0,0050,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,644
Tête enseignante GPT0,477
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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