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Enregistrement W4211211862 · doi:10.1101/2022.02.10.479926

Reducing Cholesterol in Macrophage Activates NF-kB through Mitochondria, Resulting in Epigenomic Reprogramming to Dampen Inflammation

2022· preprint· en· W4211211862 sur OpenAlexaff
Zeina Salloum, Kristin Dauner, Kiran Nakka, Neha Verma, David Valdivieso González, Víctor G. Almendro‐Vedia, Jeffery McDonald, Hina Bandukwala, Alexander Sorisky, Iván López‐Montero, Jeffery Dilworth, Xiaohui Zha

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensUniversity of OttawaOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpigenomeCell biologyInflammationReprogrammingBiologyMacrophageMFN1ABCG1Macrophage polarizationImmune systemCholesterolMitochondrionChemistryBiochemistryABCA1ImmunologyGene expressionCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cholesterol plays an important role in macrophage functions including their immune response 1 . Recently, NF- k B was shown to reprogram the epigenome in macrophages 2 . Here, we show that NF-kB pathway is activated in resting macrophages when cholesterol is reduced by statin or methyl-β-cyclodextrin (MCD). Activated NF- k B increases the expression of histone-modifying enzymes, such as demethylase JMJD3. We provide evidence that the epigenome in these macrophages is reprogrammed, likely driven by NF- k B and histone modifications 2 . We also show that cholesterol reduction in macrophages results in suppression of mitochondria respiration. Specifically, cholesterol levels in the inner membrane of the mitochondria is reduced, which impairs the efficiency of ATP synthase (complex V). Consequently, protons accumulate in the intermembrane space to active NF- k B and JMJD3, thereby modifying the epigenome. When subsequently challenged by the inflammatory stimulus lipopolysaccharide (LPS), cholesterol-reduced macrophages generate responses that are less pro-inflammatory and more homeostatic, which should favour inflammation resolution. Taken together, we describe a mechanism by which the level of mitochondrial cholesterol in resting macrophages regulates the epigenome through NF-kB, thereby preparing macrophage for future immune activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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