RXLR effector gene <i>Avr3a</i> from <i>Phytophthora sojae</i> is recognized by <i>Rps8</i> in soybean
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The use of resistance genes in elite soybean cultivars is one of the most widely used methods to manage Phytophthora sojae . This method relies on effector‐triggered immunity, where a Resistant to P. sojae ( Rps ) gene product from the plant recognizes a specific effector from the pathogen, encoded by an avirulence ( Avr ) gene. Many Avr genes from P . sojae have been identified in the last decade, allowing a better exploitation of this type of resistance. The objective of the present study was to identify the Avr gene triggering immunity derived from the soybean resistance gene Rps8 . The analysis of a segregating F 2 progeny coupled with a genotyping‐by‐sequencing approach led to the identification of a putative Avr8 locus. The investigation of this locus using whole‐genome sequencing data from 31 isolates of P . sojae identified Avr3a as the likely candidate for Avr8 . Long‐read sequencing also revealed that P . sojae isolates can carry up to five copies of the Avr3a gene, compared to the four previously reported. Haplotype and transcriptional analyses showed that amino acid changes and absence of Avr3a transcripts from P. sojae isolates caused changes in virulence towards Rps8 . Functional analyses using CRISPR/Cas9 knockout and constitutive expression demonstrated that Rps8 interacted with Avr3a . We also showed that a specific allele of Avr3a is recognized by Rps3a but not Rps8 . While Rps3a and Rps8 have been previously described as closely linked, this is the first report of a clear distinction hitherto undefined between these two resistance genes.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle