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Enregistrement W4211220379 · doi:10.1111/mpp.13190

RXLR effector gene <i>Avr3a</i> from <i>Phytophthora sojae</i> is recognized by <i>Rps8</i> in soybean

2022· article· en· W4211220379 sur OpenAlex
Geneviève Arsenault‐Labrecque, Parthasarathy Santhanam, Yanick Asselin, Benjamin Cinget, Amandine Lebreton, Caroline Labbé, François Belzile, Mark Gijzen, Richard R. Bélanger

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Pathology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanada Research ChairsGénome QuébecGenome Canada
Mots-clésPhytophthora sojaeBiologyEffectorGenePhytophthoraGeneticsComputational biologyBotanyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The use of resistance genes in elite soybean cultivars is one of the most widely used methods to manage Phytophthora sojae . This method relies on effector‐triggered immunity, where a Resistant to P. sojae ( Rps ) gene product from the plant recognizes a specific effector from the pathogen, encoded by an avirulence ( Avr ) gene. Many Avr genes from P . sojae have been identified in the last decade, allowing a better exploitation of this type of resistance. The objective of the present study was to identify the Avr gene triggering immunity derived from the soybean resistance gene Rps8 . The analysis of a segregating F 2 progeny coupled with a genotyping‐by‐sequencing approach led to the identification of a putative Avr8 locus. The investigation of this locus using whole‐genome sequencing data from 31 isolates of P . sojae identified Avr3a as the likely candidate for Avr8 . Long‐read sequencing also revealed that P . sojae isolates can carry up to five copies of the Avr3a gene, compared to the four previously reported. Haplotype and transcriptional analyses showed that amino acid changes and absence of Avr3a transcripts from P. sojae isolates caused changes in virulence towards Rps8 . Functional analyses using CRISPR/Cas9 knockout and constitutive expression demonstrated that Rps8 interacted with Avr3a . We also showed that a specific allele of Avr3a is recognized by Rps3a but not Rps8 . While Rps3a and Rps8 have been previously described as closely linked, this is the first report of a clear distinction hitherto undefined between these two resistance genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,114
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle