A microbial perspective on the local influence of Arctic rivers and estuaries on Hudson Bay (Canada)
Notice bibliographique
Résumé
A clear divide typically exists between freshwater and marine microbial communities, with transitional communities found in estuarine zones. The estuarine communities can derive from inflowing rivers and the sea via tidal mixing and incursions or be comprised of unique brackish species, depending on flow regimes and retention time within an estuary. Only a few studies have been carried out in the Arctic, where moderate salinities associated with the influence of seasonal ice melt could potentially favor marine microbes adapted to lower salinities in fresh-to-saltwater transition zones irrespective of river flows and tidal mixing. To test this idea, we examined early summer microbial communities in 2 western Hudson Bay (Canada) river-to-sea systems: the Churchill and Nelson river systems. Both rivers originate from the same headwaters, suggesting similar catchment conditions, but differ in geomorphology and hydroelectric diversions that induce very different flow and stratification regimes. Using amplicons of the V4 region of the 16S rRNA gene, we identified distinct riverine bacterial communities that were significantly different from the 2 associated estuaries and offshore communities. In the much smaller Churchill Estuary, the microbial community showed a marked influence of freshwater microbial species, along with marine influences. In contrast, in the larger high-flow Nelson River Estuary, riverine bacterioplankton were less evident in the estuary, where the marine signal was much stronger. The marine samples in both systems differed somewhat consistently with the phenology of the phytoplankton bloom in the Bay and tended to harbor distinct attached and free-living bacterial communities. Our results highlight the relevance of river flow and estuarine circulation on selection of bacterial species in estuaries, with ecological implications for food web functionality and biogeochemical cycles in the Anthropocene, where flow regimes would be affected by larger climatic variability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».