MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4212796650 · doi:10.5306/wjco.v13.i2.135

Neurotrophic receptor tyrosine kinase family members in secretory and non-secretory breast carcinomas

2022· article· en· W4212796650 sur OpenAlexaff
Athina Stravodimou, Ioannis A. Voutsadakis

Notice bibliographique

RevueWorld Journal of Clinical Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensSault Area Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerMedicineReceptor tyrosine kinaseCancer researchTyrosine kinaseCancerOncologyInternal medicineBioinformaticsReceptorBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUNDBreast cancer is the most common female cancer and a major cause of morbidity and mortality.Progress in breast cancer therapeutics has been attained with the introduction of targeted therapies for specific sub-sets.However, other subsets lack targeted interventions and thus there is persisting need for identification and characterization of molecular targets in order to advance breast cancer therapeutics. AIMTo analyze the role of lesions in neurotrophic receptor tyrosine kinase (NTRK) genes in breast cancers. METHODSAnalysis of publicly available genomic breast cancer datasets was performed for identification and characterization of cases with fusions and other molecular abnormalities involving NTRK1, NTRK2 and NTRK3 genes. RESULTSNTRK fusions are present in a small number of breast cancers at the extensive GENIE project data set which contains more than 10000 breast cancers.These cases are not identified as secretory in the database, suggesting that the histologic characterization is not always evident.In the breast cancer The Cancer Genome Atlas (TCGA) cohort the more common molecular lesion in NTRK genes is amplification of NTRK1 observed in 7.9% of breast cancers. CONCLUSIONNeurotrophin receptors molecular lesions other than fusions are observed more often than fusions.However, currently available NTRK inhibitors are effective Stravodimou A et al.NTRK in breast cancer WJCO https://www.wjgnet.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,099
Tête enseignante GPT0,433
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueWorld Journal of Clinical OncologyMême sujetHER2/EGFR in Cancer ResearchTravaux en français237 207