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Enregistrement W4212812412 · doi:10.1002/1873-3468.14322

Screening of novel fungal Carbohydrate Esterase family 1 enzymes identifies three novel dual feruloyl/acetyl xylan esterases

2022· article· en· W4212812412 sur OpenAlexafffund
Adiphol Dilokpimol, Bart Verkerk, Xinxin Li, Annie Bellemare, Mathieu Lavallée, Matthias Frommhagen, Emilie N. Underlin, Mirjam A. Kabel, Justin Powlowski, Adrian Tsang, Ronald P. de Vries

Notice bibliographique

RevueFEBS Letters · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesChina Scholarship CouncilGenome Canada
Mots-clésXylanEnzymeEsteraseBiochemistryGlycoside hydrolaseChemistryCarbohydrate-binding moduleCarbohydrate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Feruloyl esterases (FAEs) and acetyl xylan esterases (AXEs) are important enzymes for plant biomass degradation and are both present in Carbohydrate Esterase family 1 (CE1) of the Carbohydrate-Active enZymes database. In this study, ten novel fungal CE1 enzymes from different subfamilies were heterologously produced and screened for their activity towards model and complex plant biomass substrates. CE1_1 enzymes possess AXE activity, while CE1_5 enzymes showed FAE activity. Two enzymes from CE1_2 and one from CE1_5 possess dual feruloyl/acetyl xylan esterase (FXE) activity, showing expansion of substrate specificity. The new FXEs from CE1 can efficiently release both feruloyl and acetyl residues from feruloylated xylan, making them particularly interesting novel components of industrial enzyme cocktails for plant biomass degradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,150
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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