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Enregistrement W4212823401 · doi:10.1093/jcag/gwab049.049

A50 IMPACT OF SHORT CHAIN FATTY ACIDS ON PATHOGENICTY OF COMMENSAL BACTERIA IN PEDIATRIC INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

2022· article· en· W4212823401 sur OpenAlexaff
Michael Bording‐Jorgensen, T Gartke, Heather Armstrong, Eytan Wine

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiologyBacteriaPathogenic bacteriaButyrateBiologyAnaerobic bacteriaShort-chain fatty acidRuminococcusBacteroidesGut floraInflammatory bowel diseaseBacteroides fragilisBifidobacteriumClostridiumBifidobacterium longumMicrobiomeLactobacillusImmunologyAntibioticsFecesMedicineFermentationBiochemistryDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Dietary fibers are fermented by microbiota into many different compounds including short-chain fatty acids (SCFA). The gut microenvironment is essential not only for human health but also in maintaining a rich biodiversity of bacterial species. It is well known that the microbiome is altered in Inflammatory Bowel Diseases (IBD), which likely changes the microenvironment and has other health effects on individuals with IBD. Pathobionts are organisms that can induce pathology under specific conditions, and several have already been associated with IBD, such as adherent invasive Escherichia coli (AIEC) and Helicobacter hepaticus. Although these bacteria have been associated with IBD, it is still largely unknown what conditions make these bacteria become pathogenic. Aims Determine the role of SCFA composition on the pathogenic potential of commensal bacteria isolated from non-IBD and IBD pediatric patients. Methods Anaerobic bacteria were isolated during colonoscopy from pediatric IBD and non-IBD patients and identified using 16S sequencing. PMA-activated human monocytes (THP-1) and colonic epithelial cells (Caco2) were grown in the presence of SCFA (acetate, butyrate, formate, propionate, and succinate). The ability of commensal bacteria ( Bacteroides fragilis, Clostridium innocuum, Ruminococcus, Parabacteroides merdae, Bifidobacterium infantis and E. coli HB101) and the pathobiont AIEC to invade cells was assessed using a gentamicin protection assay. Immune activation was quantified with IL-1b and IL-6 by ELISA, as well as reactive oxygen species (ROS) using DCFDHA. Results The SCFA propionate and formate significantly decreased invasion for HB101 and LF82 into macrophages but not epithelial cells. Bacteria isolated from an IBD environment had a higher invasion potential independent of the addition of SCFA, compared to bacteria from a non-IBD environment. However, butyrate was found to significantly increase invasion of non-IBD B. fragilis into Caco2 cells but not macrophages. Bacteria isolated from IBD patients tended to have a higher inflammatory response with both elevated IL-1b as well as ROS production. Conclusions Microenvironment changes, such as in SCFA concentrations, during a disease state can affect the host response to microbes including commensals. Commensal bacteria from IBD patients tend to be more proinflammatory, suggesting that they play a role in driving inflammation. SCFA are beneficial factors for gut health; however, what is still unknown is the interaction between microbes and the host after microenvironmental shifts that likely causes bacterial stress. Understanding the host-microbe interactions and the role diet can have on this dynamic relationship has the potential for discovering new therapeutic options for those suffering from IBD. Funding Agencies CIHRWeston Family Foundation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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