Relationships Between Migration and Microbiome Composition and Diversity in Urban Canada Geese
Notice bibliographique
Résumé
Microbiome analysis presents an opportunity to understand how urban environments affect avian physiology. For example, habitat use can affect microbiome diversity and composition, and hosts with more diverse gut microbiota are thought to be more resistant to pathogens and have increased fitness. However, the microbiome is an understudied aspect of avian ecology, particularly in the context of migration and urbanization in wild birds. For this study, we hypothesized that, within urban birds, migrants would exhibit greater microbial diversity and inter-individual variation in microbiome composition than residents because they are exposed to more diverse habitats. We focused on Canada geese ( Branta canadensis ), one of many migratory species that exhibit increasingly more year-round residency in cities. We used 16S rRNA gene amplicon sequencing to quantify microbiome taxonomic composition in fecal samples from 32 GPS-tracked Canada geese, 22 of which were year-round residents of the Chicago area and 10 of which were migrants. Similar to recent studies on wild species feeding near human habitation, urban resident geese had higher gut microbial diversity than migrants. They also had increased inter-individual variation in microbiome composition and, on average, lower relative abundances of bacteria in the phylum Firmicutes, and the genera Terrisporobacter , Turicibacter , and Cellulosilyticum , which all have metabolic functions that may aid in goose digestion. Therefore, the gut microbiome of resident geese may provide fewer potential health benefits. These patterns may be a result of anthropogenic influences on aspects of resident goose ecology, such as diet, as well the influence of migration on migrant goose ecology and biology. Overall, our results suggest that reduced migration for urban-adapted wildlife species may have important consequences for physiology and health.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».