A51 ROLE OF GUT MICROBIOTA IN THE EPISODIC NATURE OF SYMPTOMS IN IRRITABLE BOWEL SYNDROME
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Irritable bowel syndrome (IBS) is a complex functional gastrointestinal disorder with likely heterogenous pathophysiology, multiple symptoms, and comorbidities. Growing evidence shows that the gut microbiota composition and function are altered in IBS patients. However, identifying the critical drivers of clinical expression remains challenging due to the episodic occurrence of IBS symptoms, the inherent variability in composition of gut microbiota across individuals, and high sensitivity of gut microbiota to dietary and environmental cues. Aims To identify whether changes in gut microbiota composition accompany or, predict the occurrence of symptoms. Methods 28 IBS patients (IBS-D n=20, IBS-C n=8) and 10 healthy controls (HC) were followed longitudinally for 25 weeks, collecting stool samples, and recording their symptoms weekly. Stool microbiota profiles were assessed by 16S rRNA gene sequencing using Illumina platform. The sequences were preprocessed, filtered, and annotated using DADA2 and phyloseq pipelines; statistical analyses were performed using FactomineR and microbiomeanalyst packages in R. Statistical significance was set at p<0.05. Results Multifactorial analysis of clinical data classified 950 samples in 6 clusters. Distribution of samples among the clusters was based on Bristol stool scale defining symptomatic periods (scores <3 and >4 indicating abnormal stool) and asymptomatic periods (scores 3 or 4), with several gut and mood symptoms varying significantly between the two categories. IBS-D patients, but not IBS-C patients presented with changes in symptoms severity, such as pain, diarrhea, constipation, and anxiety during the symptomatic periods. Depression scores were, however, higher in IBS-C compared to IBS-D patients. In contrast, immune makers such as fecal b-defensin-2 and calprotectin were higher during asymptomatic periods in IBS-D, but not in IBS-C patients. Bacterial diversity profiles differed among IBS patients (IBS-D and IBS-C) and HC, namely Shannon index and Bray-Curtis distance, but they did not change significantly between the symptomatic and asymptomatic periods within each subtype. Despite this, several bacterial taxa unique to each cluster were identified using linear mixed models. Conclusions Our results demonstrate the need to study patterns of co-occurrence of IBS symptoms and their severity during symptomatic and asymptomatic periods to better understand the role of identified bacterial taxa in the symptom generation. Identifying their temporal changes and cross-feeding patterns in individual patients will shed light on the underlying mechanistic role of gut microbiota in IBS, which might be otherwise obscured by group generalizations. Funding Agencies CIHR
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».