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Enregistrement W4212929679 · doi:10.1093/jcag/gwab049.057

A58 CHARACTERIZATION OF THE 37/67 KDA LAMININ RECEPTOR IN COLORECTAL CANCER CELLS

2022· article· en· W4212929679 sur OpenAlexaff
Gabriel Cloutier, Taoufik Khalfaoui, Jean‐François Beaulieu

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCytoplasmLamininRibosomeRibosomal proteinMolecular biologyCancer cellRibosomal RNACell biologyExtracellular matrixCancerBiochemistryGeneRNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The interaction between cells and extracellular matrix components like laminin or elastin is a crucial step in cancer development and the metastasis process. The 67 kDa Laminin Receptor (67LR) was one of the first cell surface receptors for laminin to be discovered in the 1980s. The 67LR has been reported to be the cytoplasmic 37 kDa small ribosomal subunit protein RPSA (40S ribosomal protein SA) combined with another yet to be identified component to become the 67 kDa membrane receptor. The mechanism by which the ribosomal protein becomes the 67LR membrane receptor is still unclear, but it is presumed that the process involves post-translational modifications combined with homo or hetero-dimerization with non-associated ribosomal proteins. Interestingly, the 67LR confers aggressiveness and a poor prognosis to a wide variety of cancers. Aims The aim of this study was to confirm the overexpression of 67LR at the membrane of colorectal cancer cells (CRC) and to identify its homo or hetero-dimerization partners. Methods To detect the expression of 67LR in colorectal cancer we performed indirect immunofluorescence on tissues from normal and diseased colons. To confirm the presence of 67LR at the membrane of CRC cells we used a cellular fractionation protocol combined with ultracentrifugation and detergent treatment to separate ribosome-containing fractions from the membranes to isolate membrane associated 67LR-related components. Mass spectrometry analysis to study the molecular identity of 67LR was performed on immunoreactive bands corresponding to RPSA and 67LR from different subcellular fractions. Results Immunolocalization of 67LR revealed an overexpression in colorectal cancer tissues. Following analysis by western blotting a 67 kDa immunoreactive protein was found in the supernatant of the 210,000 x g centrifugation while a 37 kDa protein was detected in the pellet solubilized with detergent, suggesting that the 37 kDa form is associated with the membrane. Furthermore, mass spectrometry analysis of the 67 kDa immunoreactive band present in the soluble fraction did not identify any RPSA-related peptides but found a 67 kDa elastin binding receptor (67EBP) related peptide, an elastin receptor that can also bind laminin. The identity of the 67EBP was then confirmed using a shRNA knockdown approach. Conclusions These results suggest a possible confusion between the 67 kDa laminin receptor (67LR) and 67 kDa elastin receptor (67EBP) and the possibility that the 37 kDa protein acts as a cell membrane laminin receptor. Funding Agencies CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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