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Enregistrement W4212937523 · doi:10.3389/fonc.2022.829248

The Causal Relationships Between Extrinsic Exposures and Risk of Prostate Cancer: A Phenome-Wide Mendelian Randomization Study

2022· article· en· W4212937523 sur OpenAlexfundno aff
Dongqing Gu, Mingshuang Tang, Yutong Wang, Huijie Cui, Min Zhang, Ye Bai, Ziqian Zeng, Yunhua Tan, Xin Wang, Ben Zhang

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteVetenskapsrådetNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchChongqing Postdoctoral Science Special FoundationNational Institutes of HealthNatural Science Foundation of ChongqingEuropean CommissionSwedish Cancer FoundationNational Natural Science Foundation of ChinaNational Cancer InstituteCancer Research UK
Mots-clésProstate cancerPhenomeMendelian randomizationMedicineOncologyInternal medicineCancerOdds ratioMeta-analysisBody mass indexBioinformaticsGynecologyBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Prostate cancer is the second most common cancer in males worldwide, and multitudes of factors have been reported to be associated with prostate cancer risk. Objectives We aim to conduct the phenome-wide exposed-omics analysis of the risk factors for prostate cancer and verify the causal associations between them. Methods We comprehensively searched published systematic reviews and meta-analyses of cohort studies and conducted another systematic review and meta-analysis of the Mendelian randomization studies investigating the associations between extrinsic exposures and prostate cancer, thus to find all of the potential risk factors for prostate cancer. Then, we launched a phenome-wide two-sample Mendelian randomization analysis to validate the potentially causal relationships using the PRACTICAL consortium and UK Biobank. Results We found a total of 55 extrinsic exposures for prostate cancer risk. The causal effect of 30 potential extrinsic exposures on prostate cancer were assessed, and the results showed docosahexaenoic acid (DHA) [odds ratio (OR)=0.806, 95% confidence interval (CI): 0.661-0.984, p =0.034], insulin-like growth factor binding protein 3 (IGFBP-3) (OR=1.0002, 95%CI: 1.00004-1.0004, p =0.016), systemic lupus erythematosus (SLE) (OR=0.9993, 95%CI: 0.9986-0.99997, p =0.039), and body mass index (BMI) (OR=0.995, 95%CI: 0.990-0.9999, p =0.046) were associated with prostate cancer risk. However, no association was found between the other 26 factors and prostate cancer risk. Conclusions Our study discovered the phenome-wide exposed-omics risk factors profile of prostate cancer, and verified that the IGFBP-3, DHA, BMI, and SLE were causally related to prostate cancer risk. The results may provide new insight into the study of the pathogenesis of prostate cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,307

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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