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Dissection of the polygenic architecture of neuronal Aβ production using a large sample of individual iPSC lines derived from Alzheimer’s disease patients
Takayuki Kondo, Norikazu Hara, Satoshi Koyama, Yuichiro Yada, Kayoko Tsukita, Ayako Nagahashi, Kenji Ishii, Tetsuaki Arai, Ryo Yamada, Michael W. Weiner, Paul Aisen, Ronald C. Petersen, Clifford R. Jack, William J. Jagust, John Q. Trojanowki, Arthur W. Toga, Laurel Beckett, Robert C. Green, John C. Morris, Leslie M. Shaw, Jeffrey Kaye, Joseph F. Quinn, Lisa C. Silbert, Betty Lind, Raina Carter, Sara Dolen, Lon S. Schneider, Sonia Pawluczyk, Mauricio Beccera, Liberty Teodoro, Bryan M. Spann, James B. Brewer, Helen Vanderswag, Adam Fleisher, Judith L. Heidebrink, Joanne Lord, Sara S. Mason, Colleen S. Albers, David S. Knopman, Kris Johnson, Rachelle S. Doody, Javier Villanueva‐Meyer, Munir Chowdhury, Susan Rountree, Mimi Dang, Yaakov Stern, Lawrence S. Honig, Karen L. Bell, Beau M. Ances, Maria Carroll, Mary L. Creech, Erin Franklin, Mark A. Mintun, Stacy Schneider, Angela Oliver, Daniel Marson, Randall Griffith, David Clark, David Geldmacher, John Brockington, Erik D. Roberson, Marissa Natelson Love, Hillel Grossman, Effie Mitsis, Raj C. Shah, Leyla deToledo‐Morrell, Ranjan Duara, Daniel Varón, Maria T. Greig, Peggy Roberts, Marilyn Albert, Chiadi U. Onyike, Daniel D’Agostino, Stephanie Kielb, James E. Galvin, Brittany Cerbone, Christina A. Michel, Dana M. Pogorelec, Henry Rusinek, Mony J. de Leon, Lidia Glodzik, Susan De Santi, P. Murali Doraiswamy, Jeffrey R. Petrella, Salvador Borges‐Neto, Terence Z. Wong, Edward Coleman, Charles D. Smith, Gregory A. Jicha, Peter Hardy, Partha Sinha, Elizabeth Oates, Gary Conrad, Anton P. Porsteinsson, Bonnie S. Goldstein, Kim Martin, Kelly M. Makino, M. Saleem Ismail, Connie Brand, Ruth A. Mulnard, Gaby Thai, Catherine Mc-Adams-Ortiz, Kyle Womack, Dana Mathews, Mary Quiceno, Allan I. Levey, James J. Lah, Janet S. Cellar, Jeffrey M. Burns, Russell H. Swerdlow, William M. Brooks, Liana G. Apostolova, Kathleen Tingus, Ellen Woo, Daniel Silverman, Po H. Lu, George Bartzokis, Neill R. Graff‐Radford, Francine Parfitt, Tracy Kendall, Heather Johnson, Martin R. Farlow, Ann Marie Hake, Brandy R. Matthews, Jared R. Brosch, Scott Herring, Cynthia Hunt, Christopher H. van Dyck, Richard E. Carson, Martha G. MacAvoy, Pradeep Varma, Howard Chertkow, Howard Bergman, Chris Hosein, Sandra E. Black, Bojana Stefanovic, Curtis Caldwell, Ging‐Yuek Robin Hsiung, Howard Feldman, Benita Mudge, Michele Assaly, Elizabeth Finger, Stephen Pasternack, Irina Rachisky, Dick Trost, Andrew Kertesz, Charles Bernick, Donna Munic, Marek Marsel Mesulam, Kristine Lipowski, Sandra Weıntraub, Borna Bonakdarpour, Diana Kerwin, Chuang‐Kuo Wu, Nancy Johnson, Carl Sadowsky, Teresa Villena, Raymond Scott Turner, Kathleen Johnson, Brigid Reynolds, Reisa A. Sperling, Keith A. Johnson, Gad A. Marshall, Jerome A. Yesavage, Joy L. Taylor, Barton Lane, Allyson Rosen, Jared Tinklenberg, Marwan N. Sabbagh, Christine M. Belden, Sandra A. Jacobson, Sherye A. Sirrel, Neil W. Kowall, Ronald Killiany, Andrew E. Budson, Alexander Norbash, Patricia Lynn Johnson, Thomas O. Obisesan, Saba Wolday, Joanne Allard, Alan J. Lerner, Paula Ogrocki, Curtis Tatsuoka, Parianne Fatica, Evan Fletcher, Pauline Maillard, John Olichney, Charles DeCarli, Owen Carmichael, Smita Kittur, Michael Borrie, T.-Y. Lee, Robert Bartha, Sterling C. Johnson, Sanjay Asthana, Cynthia M. Carlsson, Steven G. Potkin, Adrian Preda, Dana Nguyen, Pierre N. Tariot, Anna Burke, Nadira Trncic, Stephanie Reeder, Vernice Bates, Horacio Capote, Michelle Rainka, Douglas W. Scharre, Maria Kataki, Anahita Adeli, Earl A. Zimmerman, Dzintra Celmins, Alice D. Brown, Godfrey D. Pearlson, Karen Blank, Karen Anderson, Laura A. Flashman, Marc Seltzer, Mary L. Hynes, Robert B. Santulli, Kaycee M. Sink, Leslie Gordineer, Jeff D. Williamson, Pradeep Garg, Franklin Watkins, Brian R. Ott, Henry Querfurth, Geoffrey Tremont, Stephen Salloway, Paul Malloy, Stephen Correia, Howard J. Rosen, Bruce L. Miller, David C. Perry, Jacobo Mintzer, Kenneth Spicer, David Bachman, Nunzio Pomara, Raymundo Hernando, Antero Sarrael, Norman Relkin, Gloria Chaing, Michael Z. Lin, Lisa Ravdin, Amanda Smith, Balebail Ashok Raj, Kristin Fargher, Takeshi Iwatsubo, Hiroyuki Arai, Morihiro Sugishita, Kengo Ito, Michio Senda, Ryozo Kuwano, Takeshi Ikeuchi, Noriko Sato, Hajime Sato, Shun Shimohama, Masaki Saitoh, Rika Yamauchi, Takashi Hayashi, Seiju Kobayashi, Norihito Nakano, Junichiro Kanazawa, Takeshi Ando, Chiyoko Takanami, Masato Hareyama, Masamitsu Hatakenaka, Eriko Tsukamoto, Shinji Ochi, Mikio Shoji, Etsuro Matsubara, Takeshi Kawarabayashi, Yasuhito Wakasaya, Takashi Nakata, Naoko Nakahata, Shuichi Ono, Yoshihiro Takai, Satoshi Takahashi, Hisashi Yonezawa, Junko Takahashi, Masako Kudoh, Makoto Sasaki, Yutaka Matsumura, Yohsuke Hirata, Tsuyoshi Metoki, Susumu Hayakawa, Masayuki Takeda, Toshiaki Sasaki, K. Sera, Kazunori Terasaki, Y. SAITOH, Shoko Goto, Kuniko Ueno, Hiromi Sakashita, Kuniko Watanabe, Ken Nagata, Tetsuya Maeda, Yasushi Kondoh, Takashi Yamazaki, Daiki Takano, Mio Miyata, Hiromi Komatsu, Mayumi Watanabe, Tomomi Sinoda, Rena Muraoka, Kayoko Kikuchi, Hitomi Ito, Akihiro Sato, Toshibumi Kinoshita, Hideyo Toyoshima, Kaoru Sato, Shigeki Sugawara, Isao Ito, Fumiko Kumagai, Katsutoshi Furukawa, Masaaki Waragai, Naoki Tomita, Nobuyuki Okamura, Mari Ootsuki, Katsumi Sugawara, Satomi Sugawara, Shunji Mugikura, Atsushi Umetsu, Takanori Murata, Tatsuo Nagasaka, Yukitsuka Kudo, Manabu Tashiro, S. Watanuki, Masatoyo Nishizawa, Takayoshi Tokutake, Saeri Ishikawa, Emiko Kishida, Nozomi Sato, Mieko Hagiwara, Kumi Yamanaka, Takeyuki Watanabe, Taeko Takasugi, Shoichi Inagawa, K. Naito, Masanori Awaji, Tsutomu Kanazawa, Kouiti Okamoto, Masaki Ikeda, Tsuneo Yamazaki, Yuiti Tasiro, Syunn Nagamine, Shiori Katsuyama, Sathiko Kurose, Sayuri Fukushima, Etsuko Koya, Makoto Amanuma, Noboru Oriuti, Kouiti Ujita, Kazuhiro Kishi, Kazuhisa Tuda, Katsuyoshi Mizukami, Etsuko Nakajima, Katsumi Miyamoto, Kousaku Saotome, T. Kobayashi, Saori Itoya, Jun Ookubo, Toshiya Akatsu, Yoshiko Anzai, Junya Ikegaki, Yuuichi Katou, Kaori Kimura, Ryou Kuchii, Hajime Saitou, Kazuya Shinoda, Satoka Someya, Hiroko Taguchi, Kazuya Tashiro, Masaya Tanaka, Tatsuya Nemoto, Ryou Wakabayashi, Daisuke Watanabe, Harumasa Takano, Tetsuya Suhara, Hitoshi Shinoto, Hitoshi Shimada, Makoto Higuchi, Takaaki Mori, Hiroshi Ito, Takayuki Obata, Yoshiko Fukushima, Kazuko Suzuki, Izumi Izumida, Katsuyuki Tanimoto, Takahiro Shiraishi, Hitoshi Shinotoh, Junko Shiba, Hiroaki Yano, Miki Satake, Aimi Nakui, Yae Ebihara, Tomomi Hasegawa, Yasumasa Yoshiyama, Mami Kato, Yuki Ogata, Hiroyuki Fujikawa, Nobuo Araki, Yoshihiko Nakazato, Takahiro Sasaki, Tomokazu Shimadu, Kimiko Yoshimaru, Etsuko Imabayashi, Asako Yasuda, Etuko Yamamoto, Natsumi Nakamata, Noriko Miyauchi, Keiko Ozawa, Rieko Hashimoto, Taishi Unezawa, Takafumi Ichikawa, Hiroki Hayashi, Masakazu Yamagishi, Tunemichi Mihara, Masaya Hirano, Shinichi Watanabe, Junichiro Fukuhara, Hajime Matsudo, Nobuyuki Saito, Atsushi Iwata, Hisatomo Kowa, Toshihiro Hayashi, Ryoko Ihara, Toji Miyagawa, Mizuho Yoshida, Yuri Koide, Eriko Samura, Kurumi Fujii, Kaori Watanabe, Nagae Orihara, Toshimitsu Momose, Akira Kunimatsu, Harushi Mori, M. Takahashi, Takuya Arai, Yoshiki Kojima, Masami Goto, Takeo Sarashina, Syuichi Uzuki, Seiji Katou, Yoshiharu Sekine, Yukihiro Takauchi, Chiine Kagami, Kazutomi Kanemaru, Shigeo Murayama, Yasushi Nishina, Maria Sakaibara, Yumiko Okazaki, Rieko Okada, Yuko Iwata, Mizuho Minami, Yasuko Hanabusa, Hanae Shingyouji, Kyoko Tottori, Aya M. Tokumaru, Makoto Ichinose, Kazuya Kume, Syunsuke Kahashi, Kunimasa Arima, Tadashi Tukamoto, Shin Tanaka, Yuko Nagahusa, Masuhiro Sakata, Mitsutoshi Okazaki, Yuko Saito, Maki Yamada, Tiine Kodama, Tomoko Takeuchi, Keiichiro Ozawa, Yoshiko Kawaji, Kyouko Tottori, Yasuhiro Nakata, Satoshi Sawada, Makoto Mimatsu, Daisuke Nakkamura, Takeshi Tamaru, Shunichirou Horiuchi, Heii Arai, Tsuneyoshi Ota, Aiko Kodaka, Yuko Tagata, Tomoko Nakada, Eizo Iseki, Kiyoshi Sato, Hiroshige Fujishiro, Norio Murayama, Masaru Suzuki, Satoshi Kimura, Masanobu Takahashi, Haruo Hanyu, Hirofumi Sakurai, Takahiko Umahara, Hidekazu Kanetaka, Kaori Arashino, Mikako Murakami, Ai Kito, Seiko Miyagi, Kaori Doi, Kazuyoshi Sasaki, Mineo Yamazaki, Yasushi Arai, Akane Nogami, Sumiko Fukuda, Koichi Kozaki, Yukiko Yamada, Sayaka Kimura, Ayako Machida, Kuninori Kobayashi, Hidehiro Mizusawa, Nobuo Sanjo, Takuya Ohkubo, Hiromi Utashiro, Yukiko Matsumoto, Kumiko Hagiya, Yoshiko Miyama, Takako Shinozaki, Haruko Hiraki, Hitoshi Shibuya, Isamu Ohashi, Akira Toriihara, S. Ohtani, Toshifumi Matsui, Yu Hayasaka, Tomomi Toyama, Hideki Sakurai, Kumiko Sugiura, Hirofumi Taguchi, Shizuo Hatashita, Akari Imuta, Akiko Matsudo, Daichi Wakebe, Hideki Hayakawa, Mitsuhiro Ono, Takayoshi Ohara, Yukihiko Washimi, Yutaka Arahata, Akinori Takeda, Yoko Konagaya, Akiko Yamaoka, Masashi Tsujimoto, Hideyuki Hattori, Hisayuki Miura, Hidetoshi Endou, Syousuke Satake, Young Jae Hong, Katsunari Iwai, Kenji Yoshiyama, Masaki Suenaga, Sumiko Morita, Teruhiko Kachi, Kenji Toba, Rina Miura, Takiko Kawai, Ai Honda, Kengo Itou, Takashi Kato, Ken Fujiwara, Rikio Katou, Naohiko Fukaya, Akira Tsuji, Hitomi Shimizu, Hiroyuki Fujisawa, Tomoko Nakazawa, Takanori Sakata, Masahito Yamada, Mitsuhiro Yoshita, Miharu Samuraki, Kenjiro Ono, Moeko Shinohara, Yuki Soshi, Kozue Niwa, Chiaki Doumoto, Mariko Hata, Miyuki Matsushita, Mai Tsukiyama, Nozomi Takeda, Sachiko Yonezawa, Ichiro Matsunari, Osamu Matsui, Fumiaki Ueda, Yasuji Ryu, Masanobu Sakamoto, Yasuomi Ouchi, Madoka Chita, Yumiko Fujita, Rika Majima, Hiromi Tsubota, Umeo Shirasawa, Masashi Sugimori, Wataru Ariya, Yuuzou Hagiwara, Yasuo Tanizaki, Hidenao Fukuyama, Ryōsuke Takahashi, Hajime Takechi, Chihiro Namiki, Kengo Uemura, Takeshi Kihara, Hiroshi Yamauchi, Shizuko Tanaka-Urayama, Emiko Maeda, Natsu Taylor Saito, Shiho Satomi, Konomi Kabata, Shin‐ichi Urayama, Tomohisa Okada, Koichi Ishizu, Shigeto Kawase, Satoshi Fukumoto, Masanori Nakagawa, Takahiko Tokuda, Masaki Kondo, Fumitoshi Niwa, Toshiki Mizuno, Yoko Oishi, Mariko Yamazaki, Daisuke Yamaguchi, Kyoko Ito, Yoku Asano, Chizuru Hamaguchi, Kei Yamada, Chio Okuyama, Kentaro Akazawa, Shigenori Matsushima, Takamasa Matsuo, Toshiaki Nakagawa, Takeshi Nii, Takuji Nishida, Kuniaki Kiuchi, Masami Fukusumi, Hideyuki Watanabe, Toshiaki Taoka, Akihiro Nogi, Masatoshi Takeda, Toshihisa Tanaka, Naoyuki Sato, Hiroaki Kazui, Takashi Kudo, Masayasu Okochi, Takashi Morihara, Shinji Tagami, Noriyuki Hayashi, Masahiko Takaya, Tamiki Wada, Mikiko Yokokoji, Hiromichi Sugiyama, Daisuke Yamamoto, Shuko Takeda, Keiko Nomura, Mutsumi Tomioka, Eiichi Uchida, Yoshiyuki Ikeda, Mineto Murakami, Takami Miki, Hiroyuki Shimada, Suzuka Ataka, Motokatsu Kanemoto, Jun Takeuchi, Akitoshi Takeda, Rie Azuma, Yuki Iwamoto, Naomi Tagawa, Junko Masao, Yuka Matsumoto, Yuko Kikukawa, Hisako Fujii, Junko Matsumura, Susumu Shiomi, Joji Kawabe, Yoshihiro Shimonishi, Yukio Miki, Mitsuji Higashida, Tomohiro Sahara, Takashi Yamanaga, Shinichi Sakamoto, Hiroyuki Tsushima, Kiyoshi Maeda, Yasuji Yamamoto, Toshio Kawamata, Kazuo Sakai, Haruhiko Oda, Taichi Akisaki, Mizuho Adachi, Masako Kuranaga, Sachi Takegawa, Yoshihiko Tahara, Seishi Terada, Takeshi Ishihara, Hajime Honda, Osamu Yokota, Yuki Kishimoto, Naoya Takeda, Nao Imai, Mayumi Yabe, Kentaro Ida, Daigo Anami, S Inoué, Toshi Matsushita, Reiko Wada, Shinsuke Hiramatsu, Hiromi Tonbara, Reiko Yamamoto, Kenji Nakashima, Kenji Wada‐Isoe, Saori Yamasaki, Eijiro Yamashita, Yu Nakamura, Ichiro Ishikawa, Sonoko Danjo, Tomomi Shinohara, Miyuki Ueno, Yuka Kashimoto, Yoshihiro Nishiyama, Yuka Yamamoto, Narihide Kimura, Kazuo Ogawa, Yasuhiro Sasakawa, Takashi Ishimori, Yukito Maeda, Tatsuo Yamada, Shinji Ouma, Aika Fukuhara-Kaneumi, Nami Sakamoto, Rie Nagao, Kengo Yoshimitsu, Yasuo Kuwabara, Ryuji Nakamuta, Minoru Tanaka, Manabu Ikeda, Mamoru Hashimoto, Keiichirou Kaneda, Yuusuke Yatabe, Kazuki Honda, Naoko Ichimi, Fumi Akatuka, Mariko Morinaga, Miyako Noda, Mika Kitajima, Toshinori Hirai, Shinya Shiraishi, Naoji Amano, Shinsuke Washizuka, Toru Takahashi, Shin Inuzuka, Tetsuya Hagiwara, Nobuhiro Sugiyama, Yatsuka Okada, Tomomi Ogihara, Takehiko Yasaki, Minori Kitayama, Tomonori Owa, Akiko Ryokawa, Rie Takeuchi, Satoe Goto, Keiko Yamauchi, Mie Ito, Tomoki Kaneko, Hitoshi Ueda, Shu‐ichi Ikeda, Takao Masaki, Ban Mihara, Hirofumi Kubo, Akiko Takano, Gou Yasui, Masami Akuzawa, Kaori Yamaguchi, Toshinari Odawara, Megumi Shimamura, Mikiko Sugiyama, Atsushi Watanabe, Naomi Oota, Shigeo Takebayashi, Yoshigazu Hayakawa, Mitsuhiro Idegawa, Noriko Toya, Kazunari Ishii, Haruhisa Inoue
Notice bibliographique
RevueNature Aging · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensSt Joseph's Health CareSt Joseph's Health CentreUniversity of British Columbia HospitalSunnybrook Health Science CentreHealth Sciences CentreSt. Joseph's HospitalMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of Science LondonJapan Agency for Medical Research and DevelopmentUehara Memorial FoundationSuzuken Memorial Foundation
Mots-clésInduced pluripotent stem cellBiologyDiseaseExome sequencingNeuroimagingGeneGenome-wide association studyGeneticsGenetic architecturePhenotypeGenotypeNeuroscienceComputational biologyMedicinePathologySingle-nucleotide polymorphismEmbryonic stem cell
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations27
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentnon