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Enregistrement W4212955139 · doi:10.1895/wormbook.1.54.1

DNA Repair

2006· review· en· W4212955139 sur OpenAlexafffund
Nigel J. O’Neil

Notice bibliographique

RevueWormBook · 2006
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyDNA damageDNA repairG2-M DNA damage checkpointGeneGeneticsGenome instabilityCell biologyCaenorhabditis elegansDNA re-replicationCell cycle checkpointDNACell cycleEukaryotic DNA replication

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The integrity of the genome is essential to the health of the individual and to the reproductive success of a species. Transmission of genetic information is in a selective balance between two opposing forces, the maintenance of genetic stability versus elimination of mutational change and loss of evolutionary potential. Caenorhabditis elegans provides many advantages for the study of DNA surveillance and repair in a multicellular organism. Several genes have been identified by mutagenesis and RNA interference that affect DNA damage checkpoint and repair functions. Many of these DNA damage response genes also play essential roles in DNA replication, cell cycle control, development, meiosis and mitosis. To date, no obvious DNA damage-induced checkpoint has been described in C. elegans somatic cells. In contrast, the DNA damage response in the germ line is characterized by two spatially separate checkpoints; mitotic germ nuclei proliferation arrest and apoptosis of damaged meiotic nuclei. Both of these responses are regulated by checkpoint genes including mrt-2, hus-1, rad-5 and cep-1, the C. elegans ortholog of the human tumour suppressor p53. The germ line DNA damage checkpoints in C. elegans provide an excellent model in which to study the genes required to maintain genomic stability and to test compounds which might have tumor suppressing properties. In addition to single gene studies, integration of data from high-throughput screens has identified genes not previous implicated in the DNA damage response and elucidated novel connections between the different repair pathways. Most of the genes involved are conserved between worms and humans, and in humans, are associated with either oncogenesis or tumor-suppression. Thus, studies of the physical and functional interactions of the components of the repair pathways in C. elegans will provide information about human repair disorders and cancer predisposition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,114
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1140,128

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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