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Enregistrement W4213006239 · doi:10.1002/edn3.286

Environmental DNA detection and abundance estimates comparable to conventional methods for three freshwater larval species at a power plant discharge

2022· article· en· W4213006239 sur OpenAlex
Douglas Bradley, Kevin C. Morey, Danielle Bourque, Brooks Fost, Tzitziki Loeza‐Quintana, Robert Hanner

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueEnvironmental DNA · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesElectric Power Research Institute
Mots-clésAlewifeDorosomaGizzard shadNettingEnvironmental DNABiologyFisheryIchthyoplanktonAbundance (ecology)PerchEcologyRelative species abundanceSampling (signal processing)BiodiversityFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Early life stage (ELS) fishes provide a valuable metric for species, population, and ecosystem monitoring. Industrial, manufacturing, and power generating facilities in the United States can be required to monitor ELS fishes to assess impacts of facility intake waters. Traditional methods for collecting, identifying, and enumerating ELS fishes include ichthyoplankton netting and pumping from intake and discharge waters. However, sampling at these sites can prove challenging from logistical and safety standpoints, with added challenges of identifying and post‐processing of ELS fishes to quantify facility impacts on waterbodies for regulatory purposes. Methods utilizing environmental DNA (eDNA) may offer improvements in these areas. This study assessed the utility of novel, species‐specific qPCR assays to detect eDNA from three differentially abundant fish species (alewife ( Alosa pseudoharengus ; Wilson , 1811 ), gizzard shad ( Dorosoma cepedianum ; Lesueur , 1818 ), and yellow perch ( Perca flavescens ; Mitchill , 1814 )) at the outflow of an industrial site. eDNA concentrations were compared with abundance estimates derived from two conventional collection methods to explore the potential utility of eDNA‐based methods in future monitoring. The likelihood of detecting gizzard shad, yellow perch, and alewife in the discharge waters of the power generation station was not significantly different among eDNA, plankton netting, or pump sampling. Results suggest successful detections differ by species and time of year for each method. Gizzard shad eDNA relative abundance correlated strongly with total larval abundances captured by the pumping but not the netting methods, whereas yellow perch eDNA abundance was found to correlate with both conventional methods. Alewife was not detected by any method, consistent with documentation of the decline in this species within the lake. Overall, our study found a positive relationship between eDNA abundance and larval fish abundance in both daily and seasonal sampling, suggesting that fluctuations in eDNA concentration may be linked to larval abundance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,536
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,003
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0190,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle