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Enregistrement W4213036488 · doi:10.1093/jcag/gwab049.143

A144 CHRONIC DSS LEADS TO ALTERED EXPRESSION OF IRAK4/TPL2 PATHWAYS IN UC-COLONIZED MICE

2022· article· en· W4213036488 sur OpenAlexaff
Amber Hann, Alba Santiago, Heather J. Galipeau, Marco Constante, Kate Jackson, Přemysl Berčík, Elena F. Verdú

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColitisInflammatory bowel diseaseUlcerative colitisImmunologyImmune systemInflammationDownregulation and upregulationGut floraFecesSplenocyteProinflammatory cytokineMedicineBiologyDiseaseMicrobiologyInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Ulcerative colitis (UC) is one of two forms of inflammatory bowel disease (IBD). The exact cause of IBD is unknown but altered host-microbe interactions and genetic susceptibility are involved in its pathogenesis. Many patients with IBD do not respond to biological therapies targeting single cytokines, therefore new therapies that target common immune pathways are being developed and need to be tested in relevant preclinical models. Previously we have shown that mice colonized with UC microbiota upregulated genes related to inflammation without induction of colitis compared to healthy volunteer-colonized mice. We thus investigated whether IRAK4 and TPL2-induced pathways, new therapeutic targets in development upstream of inflammatory cytokine gene activation, are upregulated in mice colonized with UC microbiota and chronic colitis. Aims Our aim was to characterize TPL2 and IRAK4 signalling pathways and T cell phenotypes in UC-colonized mice following chronic low-dose dextran sodium sulfate (DSS) colitis. Methods 10-16-week-old germ-free C57BL/6 mice were colonized with fecal microbiota from a patient with UC experiencing a flare (n=16). Mice were housed in a gnotobiotic facility during the experiment. Three weeks following colonization, colitis was induced in half of the mice by three cycles (5 d each; 2.0%, 1.5% and 1.5%, respectively) of DSS in drinking water with a 5-d wash-out period between cycles. All mice were fed a control diet (7004, Teklad). Fecal samples were collected weekly. At sacrifice, disease activity (colon length, occult blood in feces, stool consistency, and spleen weight) was measured and colon tissue was collected for histological analysis and RNA sequencing. Mesenteric lymph nodes (MLNs) were acquired for flow cytometry to analyze T cell phenotypes. Results In UC-colonized mice, chronic low-dose DSS induced softer feces (p<0.0001), shorter colon length (p<0.0001), and increased spleen weight (p<0.0001), compared with water treated mice. This was paralleled by detectable blood in stool, development of moderate colitis (DSS: 1.9+/-1.4 vs H2O: 0.5+/-0.2; p<0.02) and higher proportion of IL-17 (p=0.003) and IFN-γ-producing T cells (p=0.06) in MLNs compared with water treated mice. RNA sequencing revealed that inflammatory genes, mainly related to the IRAK4/TPL2 pathway (e.g., Gadd45b, Socs3, Il1b), were significantly increased (p≤0.05) in the colon of mice treated with DSS compared with water. Conclusions When challenged with a chronic low-dose chemical injury agent, mice colonized with UC microbiota develop clinical and histological signs of colitis and upregulation of genes involved in inflammation like Gadd45b, Socs3, and Il1b. Thus, this model represents a new valuable tool for preclinical testing of new drug candidates, such as those related to the modulation of IRAK4/TPL2 pathways. Funding Agencies CCC

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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