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Enregistrement W4213091682 · doi:10.1016/j.talanta.2022.123327

Using machine learning and an electronic tongue for discriminating saliva samples from oral cavity cancer patients and healthy individuals

2022· article· en· W4213091682 sur OpenAlexaff
Daniel Cesar Braz, Mário Popolin Neto, Flávio M. Shimizu, Acelino Cardoso de Sá, Renato S. Lima, Ângelo L. Gobbi, Matias Eliseo Melendez, Lídia Maria Rebolho Batista Arantes, André Lopes Carvalho, Fernando V. Paulovich, Osvaldo N. Oliveira

Notice bibliographique

RevueTalanta · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Chemical Sensor Technologies
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesInstituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Eletrônica OrgânicaConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésSupport vector machineRandom forestArtificial intelligenceTongueElectronic tongueSalivaMachine learningCancerPattern recognition (psychology)Kernel (algebra)ChemistryComputer sciencePathologyMathematicsInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The diagnosis of cancer and other diseases using data from non-specific sensors - such as the electronic tongues (e-tongues) - is challenging owing to the lack of selectivity, in addition to the variability of biological samples. In this study, we demonstrate that impedance data obtained with an e-tongue in saliva samples can be used to diagnose cancer in the mouth. Data taken with a single-response microfluidic e-tongue applied to the saliva of 27 individuals were treated with multidimensional projection techniques and non-supervised and supervised machine learning algorithms. The distinction between healthy individuals and patients with cancer on the floor of mouth or oral cavity could only be made with supervised learning. Accuracy above 80% was obtained for the binary classification (YES or NO for cancer) using a Support Vector Machine (SVM) with radial basis function kernel and Random Forest. In the classification considering the type of cancer, the accuracy dropped to ca. 70%. The accuracy tended to increase when clinical information such as alcohol consumption was used in conjunction with the e-tongue data. With the random forest algorithm, the rules to explain the diagnosis could be identified using the concept of Multidimensional Calibration Space. Since the training of the machine learning algorithms is believed to be more efficient when the data of a larger number of patients are employed, the approach presented here is promising for computer-assisted diagnosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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