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Enregistrement W4213110099 · doi:10.1111/oik.08987

No evidence of foliar disease impact on crop root functional strategies and soil microbial communities: what does this mean for organic coffee?

2022· article· en· W4213110099 sur OpenAlexaff
Stephanie Gagliardi, Jacques Avelino, Roberta R. Fulthorpe, Elías de Melo Virginio Filho, Marney E. Isaac

Notice bibliographique

RevueOikos · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueCocoa and Sweet Potato Agronomy
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAgronomyTraitRoot systemCoffea arabicaCropPlant communityBotanyEcologyEcological succession

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Global climate change is increasing pest and pathogen pressures on plant communities, deteriorating optimal plant functioning. In plant communities, root functional trait expression and microbial communities are important indicators of plant functioning belowground, and, when confronted with pathogens aboveground, can simultaneously reflect plant defence strategies. Yet, while research is continuing to emerge on the response of root functional traits and microbial processes to pathogens aboveground, little work has investigated these interactions in tree‐crops, or the role organic amendments play in moderating these relationships. The main objective of this study is to disentangle the dynamic effects of pathogens and amendments on root functional traits (i.e. specific root length and area, root diameter, root length density, root nitrogen and root carbon to nitrogen ratio) and root endophytic fungal communities. As a model, we use Coffea arabica (coffee) variety Caturra along a gradient of coffee leaf rust – a foliar disease prominent in coffee systems – under contrasting but widespread amendment regimes in biodiverse agroforestry systems. We found that root trait expression varies along established conservation and collaboration gradients, where fungal endophyte community composition varies significantly as a function of root traits. Belowground resource acquisition strategies do not change with foliar disease incidence, suggesting they may be decoupled. Rather, amendment regimes differentially shape root trait expression and microbial communities, where coffee plants under organic amendments, regardless of foliar disease incidence, expressed greater acquisitive traits and enhanced collaboration with symbiotic fungi. This is an important first step in disentangling the dynamic inter‐relationships between plant traits, endophytes and pathogens, generating new questions on the role of amendments in sustainable pathogen management in biodiverse agroecosystems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,863
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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