Environmental DNA dispersal from Atlantic salmon farms
Notice bibliographique
Résumé
The spatial spread of genetic material is fundamental to analyses of invasive species, species dispersal, and disease surveillance. Using a quantitative environmental DNA methodology, we assessed spatial variation in Atlantic salmon ( Salmo salar) eDNA concentration, originating from four active salmon farms, along ∼55 km of narrow channels in British Columbia, Canada. We evaluated eDNA from 36 and 47 seawater samples collected at 2 and 8 m depths, respectively, at 0.3–3 km intervals along the channels. We fitted a Laplace dispersal kernel to eDNA data separately for 2 and 8 m depths. The model estimates that 95% of eDNA spread at 2 m depth was within 1.6 km upstream and 3.2 km downstream from farms relative to a prevailing current, and this was expanded at 8 m (1.8 km upstream; 3.7 km downstream). Our modeling results were robust to multiple sources of simulated uncertainty associated with sampling regime and variable eDNA shedding rates. Our results provide a benchmark for the spatial spread of biological material such as pathogens or eDNA from invasive or imperilled species in a coastal marine context. This work has implications for the interpretation of eDNA data for species surveillance and predicting disease spread.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».