A200 CROHN’S-ASSOCIATED <i>E. COLI</i> WORSEN COLITIS SEVERITY IN MICE COLONIZED WITH DEFINED MICROBIOTA
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Bacterial infections have been postulated to drive the dysregulated inflammation found in inflammatory bowel disease (IBD). In particular, adherent-invasive Escherichia coli (AIEC) isolated from patients with IBD have pathobiont characteristics and have been implicated in IBD pathogenesis. Aims Our aim was to characterize and compare the level of intestinal inflammation and potential microbiota shifts induced by E. coli clinical isolates using a gnotobiotic mouse model of colitis. Methods Adult germ-free C57BL/6 mice were transferred to ISO positive cages in a gnotobiotic facility and colonized with altered Schaedler flora-like (ASF) microbiota and one of three clinical E. coli isolates: E. coli C0004 (n = 5), E. coli LF82 (n = 9), E. coli NRG857c (n = 6), or ASF alone (n = 6). Three weeks later, mice were treated for 5 days with low dose dextran sodium sulphate in drinking water (2%; DSS), followed by 2 days of water. Mice were monitored daily for clinical symptoms (weight, stool consistency, and occult blood). At sacrifice, colon tissue was collected for histological analysis. Cecum contents were cultured to determine bacterial load. Fecal samples were collected for 16S rRNA gene sequencing analysis before and after DSS treatment. Results All mice colonized with an E. coli isolate displayed significantly greater clinical and microscopic scores of colitis compared to ASF alone, but the severity was dependent on the colonized E. coli strain. E. coli NRG857c-colonized mice exhibited more severe symptoms (p < 0.001) two days earlier than mice colonized with other E. coli isolates. Mice colonized with E. coli LF82 or E. coli NRG857c had higher histological scores of colitis compared to mice colonized with E. coli C0004, which were also significantly greater than ASF alone (p < 0.0001). 16S rRNA gene sequencing revealed that ASF-alone-colonized mice lacked Proteobacteria. All E. coli-colonized mice had comparable bacterial loads, which were verified by 16S rRNA analysis. Following DSS, E. coli LF82 and E. coli NRG857c relative abundance remained stable, whereas the relative abundance of Roseburia/ASF 492 declined significantly in all E. coli colonized mice. Conclusions The presence of E. coli pathobionts in mice drive the severity of chemically induced colitis, with AIEC NRG857c inducing the greatest severity. This gnotobiotic mouse model enables us to control the severity of colitis in a well-defined microbiota that is dependent on the colonized E. coli isolate. Using this model, we will be able to assess therapeutic candidates that aim to treat colitis at varying stages of its disease progression. Funding Agencies CCC, CIHRNSERC
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».