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Enregistrement W4213230575 · doi:10.1093/botlinnean/boab082

Molecular phylogenetics of<i>Euploca</i>(Boraginaceae): homoplasy in many characters, including the C4 photosynthetic pathway

2021· article· en· W4213230575 sur OpenAlexafffund
Michael W. Frohlich, Rowan F. Sage, Lyn A. Craven, Sebastian Schuster, Guillaume Gigot, Hartmut H. Hilger, Hossein Akhani, Parastoo Mahdavi, Federico Luebert, Maximilian Weigend, Mats Thulin, Jeff J. Doyle, Jane L. Doyle, Patrick J. Vogan, Alan Forrest, Timothy Fulcher, Dion S. Devey, Mark W. Chase

Notice bibliographique

RevueBotanical Journal of the Linnean Society · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Science Foundation
Mots-clésBiologyBoraginaceaePhylogenetic treeGenusBotanyPhylogeneticsPlastidConvergent evolutionEvolutionary biologyChloroplastGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We present a phylogenetic analysis using plastid (matK, rbcL) and nuclear (nrITS) DNA for diverse Euploca spp. (formerly Heliotropium section Orthostachys) from the worldwide distribution of a genus and including species encompassing the wide physiological and morphological diversity of the genus. Our results indicate that some remarkably complex features arose multiple times in parallel in Euploca, including attributes of its subsections under section Orthostachys, notably plants that, above ground, consist almost entirely of inflorescences. To elucidate in greater detail the distribution of C4 species in Euploca and Heliotropium s.s., we made > 800 δ 13C determinations, including some from the traditional genus Tournefortia. We greatly increase the number of proven C4 species in Euploca, but found none outside Euploca. Of the tested Euploca spp., c. 28% are C3 or intermediate in carbon fixation pathway. Our phylogenetic results indicate four parallel/convergent acquisitions of C4 photosynthesis or fewer origins with subsequent loss in some species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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