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Enregistrement W4213231179 · doi:10.2196/29920

RWD-Cockpit: Application for Quality Assessment of Real-world Data

2022· article· en· W4213231179 sur OpenAlexvenueno aff
Lmar Babrak, Erand Smakaj, Teyfik Agac, Petra Maria Asprion, Frank Grimberg, Daan Van der Werf, Erwin Willem van Ginkel, Deniz David Tosoni, Ieuan Clay, Markus Degen, Dominique Brodbeck, Eriberto Noel Natali, Erik Schkommodau, Enkelejda Miho

Notice bibliographique

RevueJMIR Formative Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueMobile Health and mHealth Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWellcome TrustNorthwestern University
Mots-clésComputer scienceUsabilityQuality (philosophy)Data qualityData miningData scienceSet (abstract data type)Sample (material)Metric (unit)Business

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Digital technologies are transforming the health care system. A large part of information is generated as real-world data (RWD). Data from electronic health records and digital biomarkers have the potential to reveal associations between the benefits and adverse events of medicines, establish new patient-stratification principles, expose unknown disease correlations, and inform on preventive measures. The impact for health care payers and providers, the biopharmaceutical industry, and governments is massive in terms of health outcomes, quality of care, and cost. However, a framework to assess the preliminary quality of RWD is missing, thus hindering the conduct of population-based observational studies to support regulatory decision-making and real-world evidence. OBJECTIVE: To address the need to qualify RWD, we aimed to build a web application as a tool to translate characterization of some quality parameters of RWD into a metric and propose a standard framework for evaluating the quality of the RWD. METHODS: The RWD-Cockpit systematically scores data sets based on proposed quality metrics and customizable variables chosen by the user. Sleep RWD generated de novo and publicly available data sets were used to validate the usability and applicability of the web application. The RWD quality score is based on the evaluation of 7 variables: manageability specifies access and publication status; complexity defines univariate, multivariate, and longitudinal data; sample size indicates the size of the sample or samples; privacy and liability stipulates privacy rules; accessibility specifies how the data set can be accessed and to what granularity; periodicity specifies how often the data set is updated; and standardization specifies whether the data set adheres to any specific technical or metadata standard. These variables are associated with several descriptors that define specific characteristics of the data set. RESULTS: To address the need to qualify RWD, we built the RWD-Cockpit web application, which proposes a framework and applies a common standard for a preliminary evaluation of RWD quality across data sets-molecular, phenotypical, and social-and proposes a standard that can be further personalized by the community retaining an internal standard. Applied to 2 different case studies-de novo-generated sleep data and publicly available data sets-the RWD-Cockpit could identify and provide researchers with variables that might increase quality. CONCLUSIONS: The results from the application of the framework of RWD metrics implemented in the RWD-Cockpit application suggests that multiple data sets can be preliminarily evaluated in terms of quality using the proposed metrics. The output scores-quality identifiers-provide a first quality assessment for the use of RWD. Although extensive challenges remain to be addressed to set RWD quality standards, our proposal can serve as an initial blueprint for community efforts in the characterization of RWD quality for regulated settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,034
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,108
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,181

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0340,108
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0090,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0030,007
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,456
Tête enseignante GPT0,682
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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