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Enregistrement W4213239814 · doi:10.22541/au.160372860.03692748/v1

Virologic Characteristics of Cases of COVID-19 in Northern Vietnam, January -- May, 2020

2020· preprint· en· W4213239814 sur OpenAlexaff
Hang Le Khanh Nguyen, Son Nguyen, Phuong Mai Hoang, Thanh Thi Le, Hương Trần, Long V. Pham, Thuy Nguyen, Anh Duc Dang, Mai Lien Le

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensMohawk College
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and PreventionUniversity of Oxford
Mots-clésContact tracingSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)QuarantineTransmission (telecommunications)MedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Isolation (microbiology)Diagnostic test2019-20 coronavirus outbreakVeterinary medicineVirologyOutbreakInternal medicinePathologyBiologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Vietnam confirmed its first case of SARS-CoV-2 infection on January 23, 2020 among travelers from Wuhan, China and experienced several clusters of community transmission until September. Vietnam implemented an aggressive testing, isolation, contact tracing, and quarantine strategy in response to all laboratory-confirmed cases. We report the results of SARS-CoV-2 testing during the first half of 2020 in northern Vietnam. Methods: From January through May, 2020, 15,650 upper respiratory specimens were collected from 14,470 suspected cases and contacts in northern Vietnam. All were tested for SARS-CoV-2 by real-time RT-PCR. Individuals with positive specimens were tested every 3 days until negative twice. Positive specimens from 81 individuals were cultured. Results: Among 14,470 tested individuals, 158 (1.1%) cases of SARS-CoV-2 infection were confirmed; 89 were imported and 69 were associated with community transmission. Most patients (122, 77%) became negative after two tests, with 11 and 4 still testing positive when sampled a fourth and fifth time, respectively. Among 81 specimens with Ct values <30, SARS-CoV-2 was isolated from 29 (36%). Seven patients testing positive again after testing negative had Ct values >30 and negative culture. Conclusion: Early and widespread testing for SARS-CoV-2 in northern Vietnam identified very few cases which, when combined with other aggressive strategies, may have dramatically contained the epidemic. We observed rapid viral clearance and very few positive results following clearance. Large scale molecular diagnostic testing is a critical part of early detection and containment of COVID-19 in Vietnam and will remain necessary until a vaccine is widely implemented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,189
Score d'incertitude au seuil0,928

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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