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Enregistrement W4213283092 · doi:10.1093/brain/awac074

Bi-allelic variants in <i>CHKA</i> cause a neurodevelopmental disorder with epilepsy and microcephaly

2022· article· en· W4213283092 sur OpenAlexafffund
Chiara Klöckner, J. Pedro Fernández-Murray, Mahtab Tavasoli, Heinrich Sticht, Gisela Stoltenburg‐Didinger, Leila Motlagh Scholle, Somayeh Bakhtiari, Michael C. Kruer, Hossein Darvish, Saghar Ghasemi Firouzabadi, Alex M. Pagnozzi, Anju Shukla, Katta M. Girisha, Dhanya Lakshmi Narayanan, Parneet Kaur, Reza Maroofian, Maha S. Zaki, Mahmoud M. Noureldeen, Andreas Merkenschlager, Janina Gburek‐Augustat, Elisa Calì, Selina Banu, Kamrun Nahar, Stéphanie Efthymiou, Henry Houlden, Rami Abou Jamra, Jason G. Williams, Christopher R. McMaster, Konrad Platzer

Notice bibliographique

RevueBrain · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUCLH Biomedical Research CentreMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthUniversity College LondonWellcome Trust
Mots-clésMicrocephalyEpilepsyMuscular dystrophyGeneticsBiologyHereditary spastic paraplegiaNeurodevelopmental disorderSpasticityAlleleGeneNeuroscienceMedicinePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Kennedy pathways catalyse the de novo synthesis of phosphatidylcholine and phosphatidylethanolamine, the most abundant components of eukaryotic cell membranes. In recent years, these pathways have moved into clinical focus because four of ten genes involved have been associated with a range of autosomal recessive rare diseases such as a neurodevelopmental disorder with muscular dystrophy (CHKB), bone abnormalities and cone-rod dystrophy (PCYT1A) and spastic paraplegia (PCYT2, SELENOI). We identified six individuals from five families with bi-allelic variants in CHKA presenting with severe global developmental delay, epilepsy, movement disorders and microcephaly. Using structural molecular modelling and functional testing of the variants in a cell-based Saccharomyces cerevisiae model, we determined that these variants reduce the enzymatic activity of CHKA and confer a significant impairment of the first enzymatic step of the Kennedy pathway. In summary, we present CHKA as a novel autosomal recessive gene for a neurodevelopmental disorder with epilepsy and microcephaly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,626
Score d'incertitude au seuil0,386

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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