Notice bibliographique
Résumé
Abstract The term ‘ ribonucleic acid (RNA) editing’ describes a variety of mechanistically unrelated biochemical activities that alter RNA molecules after transcription by addition, deletion or substitution of nucleotides. Examples include insertion and deletion of uridine residues in the mitochondrial messenger RNAs (mRNAs) of kinetoplastid protozoa; cytidine‐to‐uridine deamination of specific residues in the mitochondrial mRNAs and transfer RNAs (tRNAs) of land plants; conversion of adenosine to inosine via deamination in the nuclear transcripts of metazoan animals; and replacement of nonbase‐paired nucleotides at the 5′ and 3′ ends of certain mitochondrial tRNAs. A three‐stage ‘constructive neutral evolution’ (CNE) model, illustrated by specific examples, can explain in a general way how RNA‐editing systems might arise and become fixed. The CNE model proposes that potential editing systems arise before there is an actual requirement for editing, thereby serving to relax functional constraints at the genome level because harmful/lethal mutations are able to be reversed at the level of the corresponding transcript. Key Concepts: RNA editing is a process (typically post‐transcriptional) that alters the nucleotide sequence of an RNA molecule relative to the corresponding gene sequence. Two general types of RNA editing are recognised: (1) insertional, in which nucleotides are added to (and also deleted from) internal positions and (2) substitutional, in which one nucleotide type replaces another at particular positions. All types of cellular RNA (messenger, transfer and ribosomal) may undergo editing, as well as intron, noncoding and viral sequences. RNA‐editing systems are almost exclusively restricted to eukaryotes, and are especially prominent in chloroplasts and mitochondria. RNA‐editing systems are clearly derived traits, arising relatively recently within particular eukaryotic lineages. RNA‐editing systems are mechanistically diverse and biochemically distinct, pointing to numerous separate evolutionary origins. A ‘constructive neutral evolution’ (CNE) model provides a general explanation for the emergence of diverse RNA‐editing systems. A basic tenet of the CNE model is that potential RNA‐editing systems arise before there is a need for editing. The emergence of an RNA‐editing system allows fixation of otherwise deleterious mutations that can be ‘repaired’ by RNA editing.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».