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Enregistrement W4213306376 · doi:10.55251/jmbfs.5478

IN VITRO EFFECT OF NEWLY BACTERIOPHAGES ISOLATES AGAINST ESCHERICHIA COLI SEROGROUPS COLLECTED FROM THE LOCAL HOSPITAL LABORATORY; THEIR SPECIFIC CHARACTERIZATION AND IDENTIFICATION

2022· article· en· W4213306376 sur OpenAlexfundno aff
Nidham Jamalludeen, Dania Shakir

Notice bibliographique

RevueJournal of Microbiology Biotechnology and Food Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of BasrahUniversity of Guelph
Mots-clésLytic cycleEscherichia coliMicrobiologyMyoviridaeBacteriophageBiologyEcoRILysisBacteriaVirologyRestriction enzymeDNAMolecular biologyVirusGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of this study is to isolate a new bacteriophage with lytic effect against several serogroups of Escherichia coli that were isolated from different samples submitted to the local hospital laboratory. These serogroups are the main causative agents of bloodstream and urinary tract infections (UTIs) among Gram-negative bacteria. Three isolates of E. coli were used as a host to isolate phages from a hospital wastewater treatment plant. Eight phages were isolated and only three of them (EC-BSR1, EC-BSR2, and EC-BSR3) were considered for further characterization and identification. The three phages appear to belong to Myoviridae characterized by icosahedral heads, necks and contractile tails with tail fibers. Phage EC-BSR1 and EC-BSR2 had genome sizes of 67.06 and 68.04 kb, respectively. All three phages were lysed 100% of E. coli serogroups that was tested in vitro and 42.7%, 61.7% and 44.7% in vitro lyses of ECOR collection reference. Phages were resistant to pH from 5 to 9, and phage EC-BSR3 appeared to be more resistant than the other two phages to an acidic and alkaline environment. These phages have the pattern of homologous DNA fragments after being digested with Acc1 and EcoR1 restriction enzymes. It was concluded that these phages are highly coli lytic for the E. coli serogroups isolates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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